面包车拆除座位属于非法改装车辆的行为，这一行为违反了《中华人民共和国道路交通安全法》中关于不得擅自改变机动车已登记的结构、构造或特征的规定。针对此类违法行为，交通管理部门会采取一系列处罚措施，以确保道路交通安全和车辆合规性。

一、具体处罚措施

1. 责令恢复原状： 交通管理部门在发现面包车拆除座位后，会首先要求车主或驾驶员立即恢复车辆至原始状态，即重新安装合法的座椅。这是为了确保车辆符合其设计时的安全标准，减少行车过程中的安全隐患。

2. 罚款：

   • 根据《机动车登记规定》，擅自改变机动车外形和已登记的有关技术数据的，公安机关交通管理部门可处警告或者五百元以下罚款。
   • 同时，根据违法情节的轻重，处罚也可能是警告或二十元以上二百元以下的罚款。具体罚款数额会因地区而异，需参照当地交通管理部门的具体执行标准。

3. 记分： 根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》，驾驶非法改装的机动车上道路行驶的，一次记1分。这一记分制度旨在通过经济处罚和记分累积的方式，对违法行为人进行警示和教育。

二、特殊情况说明

若面包车拆除座位是为了某些特殊用途，如封闭厢式面包车拆除后排座位用于合法的载货运输，并且已经按照相关规定向车辆管理部门申请了变更登记等手续，那么这种行为则不被视为违法，不会受到上述处罚。但这种情况需要严格遵守相关法律法规，并确保所有手续齐全、合规。

三、其他后果与风险

1. 行车安全： 面包车拆除座位会导致车内重心不稳，增加行车过程中的安全隐患。在高速行驶或紧急制动时，这种不稳定性可能更加明显，对乘客和驾驶员的生命安全构成威胁。

2. 保险拒赔： 如果因拆除座位导致的车辆结构改变而引发交通事故，保险公司可能会以车主擅自改变车辆结构为由拒绝赔付。这将给车主带来经济损失，并可能影响其未来的保险购买和理赔。

四、建议与措施

鉴于上述法律风险和安全隐患，我强烈建议面包车车主不要擅自拆除或改装车辆座椅。如果确实需要改变车辆用途或进行改装，必须事先向车辆管理部门申请并获得批准。同时，车主应定期检查车辆状况，确保所有部件都符合安全标准，以保障行车安全。

综上所述，面包车拆除座位将面临法律处罚和安全风险。车主应严格遵守相关法律法规，确保车辆合规性和行车安全。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请咨询当地的交通管理部门或专业律师。