结论前置：公司让员工签欠款单是否合法，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

1. 若欠款单基于真实债务关系：

   • 法律背景：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合法的债权债务关系受法律保护。如果员工确实欠公司款项（如因预支工资、借款等），且双方对此无争议，那么签订欠款单是合法的，这可以视为双方对债务关系的确认和书面记录。
   • 法律建议：在此情况下，欠款单应明确记载欠款金额、欠款原因、还款期限等关键信息，并由双方签字或盖章确认，以确保其法律效力。

2. 若欠款单并非基于真实债务关系：

   • 法律背景：如果公司以胁迫、欺诈等手段迫使员工签订欠款单，或者欠款单上的金额与实际债务不符，那么这种行为可能构成违法。根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关法律法规，用人单位不得以任何非法手段强迫劳动者劳动或签订不利于劳动者的协议。
   • 法律后果：员工有权拒绝签订不真实的欠款单，并可以向劳动监察部门投诉或寻求法律援助。如果已签订，员工可以在知道或应当知道权利被侵害之日起一年内申请劳动争议仲裁，要求确认欠款单无效或撤销。

3. 特殊情况：以欠款单形式抵扣工资或奖金：

   • 法律分析：有些公司可能会以员工欠款为由，直接从工资或奖金中扣除相应金额，并要求员工签订欠款单作为“确认”。这种行为是否合法，取决于是否符合劳动合同的约定以及相关法律法规的规定。如果劳动合同中明确规定了此类扣除条款，且扣除金额合理、程序合法，那么可能被视为合法。但如果没有约定或约定不明确，公司单方面扣除工资或奖金并要求签订欠款单，则可能构成违法。
   • 法律建议：员工在签订此类欠款单前，应仔细审查劳动合同中的相关条款，并了解自己的权益。如果认为公司的行为违法或不合理，可以拒绝签订并寻求法律援助。

进一步思考：在处理此类问题时，员工应保留好相关证据（如工资条、银行转账记录、欠款单等），以便在发生争议时维护自己的权益。同时，建议员工在签订任何协议前，都仔细阅读协议内容，并咨询专业人士（如律师）的意见，以确保自己的合法权益不受侵害。

总结：公司让员工签欠款单是否合法，取决于欠款单是否基于真实的债务关系、是否违反法律法规的强制性规定以及是否符合劳动合同的约定。员工在面对此类情况时，应保持警惕并咨询专业人士的意见。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。