结论前置：没有正式的合同，但有协议书的情况下，欠款纠纷是可以立案的。接下来，我将从多个角度为您详细分析这一问题。

一、协议书的法律效力

协议书，作为双方意思表示一致的书面文件，在法律上具有一定的效力。只要协议书内容合法、双方自愿签署，且不违反法律法规的强制性规定，那么这份协议书就是有效的，可以作为双方权利义务的依据。在欠款纠纷中，协议书可以明确双方之间的债权债务关系，包括欠款金额、还款期限、利息等关键条款。

二、立案的法律依据

根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，起诉必须符合以下条件：

1. 原告是与本案有直接利害关系的公民、法人和其他组织；
2. 有明确的被告；
3. 有具体的诉讼请求和事实、理由；
4. 属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖。

在欠款纠纷中，只要您能提供有效的协议书作为证据，证明双方之间存在债权债务关系，且符合上述立案条件，那么法院就会受理您的案件。

三、协议书作为证据的重要性

在欠款纠纷中，协议书是证明双方债权债务关系的关键证据。与口头协议相比，书面协议书具有更高的证明力，因为它能够清晰地记录双方的权利义务关系，减少争议和误解。因此，在签订协议书时，建议您务必确保内容完整、明确，并妥善保存原件，以便在需要时作为证据使用。

四、可能遇到的法律问题及建议

1. 协议书内容不完整或存在歧义：如果协议书内容不完整或存在歧义，可能会导致双方对债权债务关系产生争议。因此，在签订协议书时，建议您务必仔细阅读条款内容，确保双方对各项条款的理解一致。如有必要，可以请专业律师协助起草或审查协议书。

2. 被告不履行还款义务：如果被告不履行还款义务，您可以依据协议书向法院提起诉讼，要求被告履行还款义务并承担违约责任。在诉讼过程中，您需要提供充分的证据证明被告确实存在欠款行为，并按照法院的判决要求被告履行还款义务。

3. 协议书无效或被撤销：如果协议书存在无效或被撤销的情形（如违反法律法规的强制性规定、欺诈、胁迫等），那么您可能无法依据协议书要求被告履行还款义务。在这种情况下，您需要寻求其他法律途径来维护自己的权益，如提起侵权之诉等。

最后，没有正式的合同但有协议书的情况下，欠款纠纷是可以立案的。但为了确保您的权益得到充分保障，建议您在签订协议书时务必谨慎对待，并妥善保存相关证据。如果您在欠款纠纷中遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。