在同案中，一般不可以由不同的检察机关起诉，但在特定情况下可能存在例外。以下是对这一问题的详细分析：
一、一般原则：同一案件由同一检察机关起诉
在刑事诉讼中，通常遵循“一案一诉”的原则，即同一案件由同一检察机关负责审查起诉。这一原则有助于确保案件的连贯性、一致性和效率性，避免不同检察机关之间可能出现的管辖冲突、证据收集重复或遗漏等问题。
二、特定情况下的例外
尽管存在一般原则，但在某些特定情况下，同案中可能由不同的检察机关起诉。这些情况主要包括：
管辖权变更：
- 在案件审查起诉过程中，如果发现原检察机关对案件没有管辖权，或者管辖权发生变更（如因行政区划调整、级别管辖变化等），则案件可能会被移送至有管辖权的检察机关。这种情况下，原检察机关和新的检察机关可能分别就案件的不同部分或不同阶段进行起诉。但严格意义上讲，这并非同一案件由两个不同检察机关同时起诉，而是管辖权变更后的结果。
共同犯罪案件的分案处理：
- 在共同犯罪案件中，如果犯罪嫌疑人众多、案情复杂，或者存在其他需要分案处理的情形，检察机关可能会将案件拆分为多个部分，分别由不同的检察机关或同一检察机关的不同部门进行起诉。但这种情况下的分案处理，通常是在同一检察机关的内部协调下进行的，且各分案之间仍保持紧密的联系和协调。从外部视角看，可能仍视为同一检察机关在处理同一案件。不过，若因特殊原因（如地域管辖、级别管辖等）确实需要由不同检察机关分别起诉，则可能构成例外。
上级检察机关指定管辖：
- 在某些特殊情况下，上级检察机关可能会指定下级检察机关对某一案件进行管辖。如果指定管辖涉及多个下级检察机关，且这些检察机关分别负责案件的不同部分或不同阶段，则可能出现同一案件由不同检察机关起诉的情况。但这种情况较为罕见，且通常会在上级检察机关的统一协调下进行。
三、法律建议与风险提示
对于检察机关：
- 在处理案件时，应严格遵守管辖规定，确保案件的合法性和有效性。
- 如需分案处理或指定管辖，应依法进行，并确保各分案或指定管辖之间的协调性和一致性。
对于犯罪嫌疑人或被告人：
- 如发现同一案件可能由不同检察机关起诉，应及时向检察机关或法院提出异议，并寻求法律帮助。
- 在案件处理过程中，应积极配合检察机关的工作，确保案件的顺利推进。
对于一般公众：
- 了解并遵守刑事诉讼的相关规定，尊重检察机关的管辖权和处理决定。
- 如对检察机关的处理决定有异议，可通过合法途径提出申诉或控告。
如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业、全面的法律意见。