公司和有竞业协议的员工签订合同，主要存在以下风险：

1. 竞业限制协议效力风险：

   • 协议内容合法性：竞业限制协议必须符合法律法规的规定，包括但不限于竞业限制的范围、地域、期限等。若协议内容超出法定范围或存在显失公平的条款，可能被认定为无效或部分无效。例如，竞业限制期限超过两年，根据《劳动合同法》的规定，超出部分将无效。
   • 员工身份适用性：竞业限制协议通常适用于高级管理人员、高级技术人员和其他负有保密义务的人员。若公司错误地与不适用竞业限制的员工签订了此类协议，该协议可能因主体不适格而被认定无效。

2. 经济补偿支付风险：

   • 补偿支付义务：根据《劳动合同法》的规定，公司在竞业限制期限内应按月给予员工经济补偿。若公司未支付或未足额支付经济补偿，员工有权请求解除竞业限制协议，并可能要求公司支付拖欠的补偿及额外赔偿。
   • 补偿标准合理性：经济补偿的标准应合理，既能体现对员工因竞业限制而可能遭受的损失的补偿，又不能过高或过低。若补偿标准不合理，可能引发劳动争议，影响公司声誉和劳动关系稳定。

3. 违约责任承担风险：

   • 员工违约：若员工违反竞业限制协议，如到与本公司有竞争关系的企业工作或自行从事与本公司有竞争关系的业务，公司有权要求员工承担违约责任，包括支付违约金、赔偿损失等。然而，违约金的数额应合理，且公司需证明其因员工违约而遭受的实际损失。
   • 公司违约：若公司违反竞业限制协议，如未按时支付经济补偿或违反协议中的其他约定，员工同样有权要求公司承担违约责任。这可能导致公司面临法律诉讼和声誉损失。

4. 商业秘密泄露风险：

   • 保密义务履行：竞业限制协议通常与保密义务相关联。若员工在竞业限制期限内泄露公司商业秘密，公司有权要求员工承担法律责任。然而，公司需证明员工存在泄露行为，且该行为给公司造成了实际损失。
   • 保密措施有效性：公司应采取有效的保密措施，如签订保密协议、限制访问敏感信息等，以降低商业秘密泄露的风险。若公司保密措施不到位，可能难以证明员工泄露商业秘密的行为，从而无法有效维护自身权益。

法律建议：

• 完善协议内容：公司在与员工签订竞业限制协议时，应确保协议内容合法、合理，明确竞业限制的范围、地域、期限及经济补偿标准等关键条款。
• 加强保密管理：公司应建立健全保密管理制度，采取有效的保密措施，如签订保密协议、限制访问敏感信息、定期进行保密培训等，以降低商业秘密泄露的风险。
• 及时支付补偿：公司应按照协议约定及时、足额支付经济补偿，以维护员工的合法权益和劳动关系的稳定。
• 依法维权：若员工违反竞业限制协议或泄露商业秘密，公司应及时收集证据，依法向劳动争议仲裁机构或人民法院提起仲裁或诉讼，以维护自身合法权益。

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