员工因盗窃被开除后，用人单位仍需支付其已工作期间的工资，但可根据具体情况依法扣除部分作为经济赔偿。以下是对这一问题的详细分析：

一、工资支付的义务

根据《中华人民共和国劳动法》第五十条及《工资支付暂行规定》第九条的规定，工资是劳动者付出劳动后应得的报酬，用人单位应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠。即使员工因盗窃被辞退，其已工作期间的工资仍应得到支付。这是因为工资与员工是否存在违纪行为是两个不同的法律关系，用人单位不能以此为由剥夺员工获取已付出劳动对应工资的权利。

二、经济损失的赔偿

如果员工的盗窃行为给用人单位造成了经济损失，用人单位有权要求赔偿。这种赔偿可以从员工的工资中扣除，但需遵守以下规定：

1. 扣除比例限制：每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。
2. 最低工资标准保障：扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准。若扣除后的剩余工资低于当地月最低工资标准，则应按最低工资标准支付。

举例说明：假设员工月工资为5000元，因盗窃行为给单位造成了2000元的经济损失。根据规定，单位最多可扣除其当月工资的20%，即1000元作为赔偿。因此，单位应支付该员工剩余的4000元工资（若当地最低工资标准高于4000元，则按最低工资标准支付）。

三、解除劳动合同的合法性

用人单位可以依据《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条的规定，因员工严重违反劳动纪律或用人单位规章制度（如盗窃）而解除劳动合同。但此解除行为必须合法，且不影响员工获得已付出劳动的报酬。如果用人单位的规章制度未明确将盗窃行为列为开除情形，或规章制度未经过民主程序制定并公示，那么用人单位的开除行为可能构成违法解除劳动合同，此时需要按照《劳动合同法》的相关规定支付赔偿金。不过，在员工因盗窃被开除的情况下，通常用人单位无需支付经济补偿，因为盗窃属于严重违纪行为。

四、实际操作建议

1. 确保解除劳动合同的合法性：用人单位在处理员工盗窃问题时，应首先确保自身行为的合法性，遵循相关法律法规的规定。
2. 详细记录损失情况：对于确因盗窃造成经济损失的情况，用人单位应详细记录损失情况，并与员工进行协商，按照法律规定进行赔偿款的扣除。
3. 及时报警并配合司法机关：若员工盗窃行为涉嫌犯罪，用人单位应及时报警并配合司法机关的工作。

综上所述，员工因盗窃被开除后，用人单位仍需履行工资支付义务，但同时也有权依法要求员工赔偿因其行为造成的经济损失。在处理此类问题时，用人单位应严格遵守法律法规，确保自身行为的合法性和正当性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。