结论：高校课题组负责人不交科研用房房费，是否可以扣工资，不能一概而论，需根据具体情况判断。以下从不同角度进行分析：

一、从劳动合同和规章制度的角度

1. 劳动合同约定：

   • 如果高校与课题组负责人的劳动合同中明确约定了房费缴纳与工资发放的挂钩条款，即不交房费将扣除相应工资，那么高校在符合法律程序的前提下，有权按照合同约定扣除工资。
   • 但需注意，此类条款必须合法、合理，且不得违反法律法规的强制性规定，如最低工资标准等。

2. 规章制度规定：

   • 高校作为用人单位，有权制定内部规章制度来管理员工行为。如果规章制度中明确规定了不交科研用房房费将扣除工资，且该规章制度已经过民主程序制定、公示或告知员工，那么高校在符合法律程序的前提下，也有权按照规章制度扣除工资。
   • 同样，规章制度也必须合法、合理，不得侵犯员工的合法权益。

二、从法律原则和规定角度

1. 工资支付原则：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》等相关法律法规，用人单位应当按时足额支付劳动者工资，不得克扣或者无故拖欠。
   • 如果高校以不交房费为由扣除工资，且该扣除行为没有法律依据或合同约定，那么这种行为可能构成违法克扣工资，劳动者有权向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。

2. 科研用房房费性质：

   • 科研用房房费通常属于高校与课题组负责人之间的民事合同关系，与劳动合同关系相对独立。
   • 如果课题组负责人未按照民事合同约定缴纳房费，高校应当通过民事诉讼等法律途径解决，而不是直接扣除工资。

三、实际操作建议

1. 协商解决：

   • 高校与课题组负责人之间应当首先通过协商解决房费缴纳问题，避免直接采取扣除工资等激烈措施。

2. 完善合同和规章制度：

   • 高校应当在劳动合同和规章制度中明确房费缴纳与工资发放的关系，以及违反规定的处理措施，确保合法合规。

3. 依法维权：

   • 如果高校违法扣除工资，课题组负责人有权向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，维护自己的合法权益。

总结：高校课题组负责人不交科研用房房费，是否可以扣工资，需根据劳动合同、规章制度以及法律法规的具体规定来判断。在处理此类问题时，高校应当遵循合法、合理、公平的原则，避免侵犯员工的合法权益。如果遇到相关问题，建议直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见。