结论：房主已与银行结清借款后，银行无权继续保管不动产证。
详细分析：
不动产证的性质与归属：
- 不动产证，即不动产权属证书，是权利人享有该不动产物权的证明。它直接关联到房产的所有权，是房主对房产拥有合法权利的凭证。
- 在房主与银行之间的借款关系中，不动产证可能作为抵押物被银行保管，但这仅是基于借款合同和抵押合同的约定，且这种保管是暂时的，旨在保障银行的债权安全。
借款结清后的法律后果：
- 当房主与银行之间的借款关系因结清而终止时，基于该借款关系而产生的抵押关系也相应消灭。
- 既然抵押关系已经消灭，银行继续保管不动产证就失去了法律基础。此时，银行应当返还不动产证给房主，以恢复房主对房产的完整物权。
银行的义务与责任：
- 银行在借款结清后，有义务及时返还不动产证给房主。这是银行作为金融机构应尽的诚信义务和合同义务。
- 如果银行无正当理由拒绝返还不动产证，房主有权通过法律途径要求银行返还，并可能要求银行承担因此造成的损失。
实际操作中的建议：
- 房主在结清借款后，应主动与银行联系，要求返还不动产证。
- 如果银行拒绝返还或拖延返还，房主可以保留相关证据（如借款结清证明、与银行的沟通记录等），并向当地房地产管理部门或法院寻求帮助。
法律背景：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，物权是权利人依法对特定的物享有直接支配和排他的权利。不动产证作为物权的证明，其归属应与物权归属一致。
- 在抵押关系中，抵押权人在债务履行期限届满未受清偿时，有权与抵押人协议以抵押物折价或者以拍卖、变卖该抵押物所得的价款受偿。但一旦债务得到清偿，抵押关系即消灭，抵押权人应返还抵押物或相关权属证书。
可能后果：
- 如果银行在借款结清后继续保管不动产证，可能构成对房主物权的侵犯，房主有权要求银行返还并可能要求赔偿损失。
- 长期不返还不动产证还可能影响房主对房产的正常使用和处分，如出售、出租等。
综上所述，房主在结清与银行的借款后，银行无权继续保管不动产证，应主动返还给房主。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。