结论前置：在厂里上班时，有案底并不会直接导致你与同事的聊天内容被查。但需注意，特定情况下，如涉及违法犯罪线索或公司有特殊规定，相关部门或公司可能会进行调查。
详细分析：
一般情况下的隐私保护：
- 在日常工作中，与同事的聊天内容通常属于个人隐私范畴，受到法律保护。除非涉及违法犯罪活动或公司有明确的规章制度要求监控员工通信，否则，一般不会有第三方（包括公司管理层或警方）主动调查你的聊天内容。
涉及违法犯罪线索的情况：
- 如果你与同事的聊天内容中涉及违法犯罪的线索或证据，如讨论如何实施犯罪、泄露公司机密等，那么这些内容可能会成为警方调查的对象。在这种情况下，警方有权根据法律程序，如搜查令、监控等，来获取相关证据。但这种情况是特定的，且需要满足一定的法律条件。
公司规章制度的影响：
- 有些公司可能出于安全、管理或合规的考虑，制定了监控员工通信的规章制度。然而，这种监控通常需要在员工入职时明确告知，并获得员工的同意。如果公司未经员工同意就擅自监控其通信内容，那么这种行为可能侵犯员工的隐私权，员工有权向相关部门投诉或寻求法律援助。
案底对聊天内容调查的影响：
- 有案底本身并不会直接导致你的聊天内容被查。案底是指个人过去的犯罪记录，它主要影响的是个人在就业、出国等方面的资格和条件。除非你的案底与当前正在调查的违法犯罪活动有关，否则警方或公司通常不会因为你有案底就主动调查你的聊天内容。
法律建议：
- 保护个人隐私：在日常工作中，注意保护自己的个人隐私，避免在聊天中泄露过多个人信息或敏感内容。
- 遵守公司规章制度：如果公司有明确的规章制度要求监控员工通信，请确保自己了解并遵守这些规定。如果认为公司的监控行为侵犯了自己的隐私权，可以与公司沟通或寻求法律援助。
- 配合警方调查：如果警方因调查违法犯罪活动而需要获取你的聊天内容，请配合警方的调查工作，但同时也有权要求警方出示合法的搜查令或监控手续。
可能后果：
- 如果聊天内容涉及违法犯罪活动，且被警方查实，你可能会面临相应的法律责任。
- 如果公司未经你同意就擅自监控你的通信内容，并因此侵犯了你的隐私权，你可以向相关部门投诉或寻求法律援助，要求公司承担相应的法律责任。
如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。