公司以员工违反保密协议但未造成损失为由起诉，法院是会受理的，但能否胜诉需视具体情况而定。以下从多个角度进行分析：
一、法院受理的可能性
起诉条件：根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，起诉需满足原告与本案有直接利害关系、有明确的被告、有具体的诉讼请求和事实理由，以及属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖等条件。公司以员工违反保密协议为由起诉，若满足上述条件，法院通常会受理。
保密协议的法律效力：保密协议是双方自愿签订的，且内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗的，该协议具有法律效力。公司有权依据保密协议向法院提起诉讼，要求员工承担违约责任。
二、胜诉的关键因素
保密协议的约定：保密协议中应明确约定保密信息的范围、保密义务的具体内容、违约责任等条款。若协议中明确规定了员工违反保密义务需承担的责任，且该约定合法有效，则公司胜诉的可能性较大。
员工是否违反保密协议：公司需提供充分证据证明员工确实违反了保密协议，如员工泄露了保密信息、将保密信息用于非约定用途等。若公司无法提供充分证据，则可能面临败诉风险。
是否造成损失：虽然公司起诉时可能未主张实际损失，但法院在审理过程中仍会考虑员工违反保密协议是否给公司造成了潜在损失或不良影响。若公司能证明员工的行为对公司造成了潜在损失或不良影响，如商业机会的丧失、客户信任的降低等，则有助于公司胜诉。然而，即使未造成实际损失，若保密协议中明确规定了违约责任，且员工确实违反了保密义务，公司仍有可能胜诉。
三、法律建议
完善保密协议：公司在与员工签订保密协议时，应明确约定保密信息的范围、保密义务的具体内容、违约责任等条款，以确保协议的合法性和有效性。
加强证据收集：公司应加强证据收集工作，如保存员工泄露保密信息的证据、记录员工违反保密义务的行为等，以便在起诉时提供充分证据支持其主张。
咨询专业律师：在处理此类纠纷时，公司应咨询专业律师的意见，以便更好地了解法律程序和诉讼策略，提高胜诉的可能性。
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