员工在依法休年假期间，用人单位不应扣除全勤奖，这是不符合劳动法规定的。以下从多个角度为您详细分析：
一、法律依据明确支持员工休年假期间的全勤权益
《职工带薪年休假条例》的规定：
- 根据该条例第二条，职工连续工作1年以上的，享受带薪年休假。单位应当保证职工享受年休假，且职工在年休假期间享受与正常工作期间相同的工资收入。这明确规定了年休假是员工的法定权利，休假期间应获得全额工资，不应影响全勤的评定。
《中华人民共和国劳动法》的规定：
- 劳动法第五十一条规定，劳动者在法定休假日以及依法参加社会活动期间，用人单位应当依法支付工资。年休假作为劳动者的法定假期，自然包含在内。因此，用人单位在员工休年假期间，必须依法支付工资，不得扣减任何形式的劳动报酬，包括全勤奖。
二、全勤奖与年假的性质分析
全勤奖的设置目的：
- 全勤奖是企业为激励员工出满勤、保证工作正常开展而设立的奖励机制。其目的在于鼓励员工在正常工作日内不无故缺勤、迟到、早退。
年假的性质：
- 年假是法律赋予劳动者的休息休假权，是劳动者的重要权益。员工休年假是行使法定权利，并非无故缺勤。因此，将休年假视为违反全勤条件，从法律和逻辑上都是站不住脚的。
三、特殊情况下的处理与建议
用人单位规章制度的规定：
- 尽管法律有明确规定，但部分用人单位可能在规章制度中对全勤有特定定义，甚至规定年休假不属于全勤范畴。然而，此类规定必须经过民主程序制定，内容不违反法律法规，且已向劳动者公示或告知，才对劳动者具有约束力。即便如此，此类规定也可能因限制劳动者合法权益而无效。
员工的权利救济途径：
- 如用人单位因员工休年假而扣全勤奖，员工首先应与用人单位协商，要求其按法律规定和合理制度执行，补发全勤奖。
- 协商不成时，员工可向当地劳动监察部门投诉举报，或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
四、实际案例与启示
- 在实践中，已有不少因用人单位扣除休年假员工全勤奖而引发的劳动争议案件。这些案件中，法院或劳动仲裁机构往往依据《职工带薪年休假条例》和《中华人民共和国劳动法》的相关规定，判决用人单位补发全勤奖，并可能对用人单位的违法行为进行处罚。
总结与建议：
员工在休年假期间应享受与正常工作期间相同的待遇和福利，包括全勤奖等奖励制度。用人单位应遵守劳动法规定，保障员工的合法权益不受侵害。如遇到因休年假而被扣除全勤奖的情况，员工应依法维权，通过沟通协商、投诉举报或劳动仲裁等途径保护自己的合法权益。如果您有进一步的法律问题或需要具体的法律帮助，请直接向我咨询，我会为您提供专业、全面的法律服务。