地上有建筑物的情况下，能否办理农转用需分情况讨论，核心在于建筑物合法性及是否符合农转用审批条件，具体分析如下：
若建筑物为合法建设且符合农转用规划
根据《土地管理法》第四十四条，农转用（即农用地转为建设用地）需经省级政府或国务院审批，且需符合土地利用总体规划、城乡规划等法定条件。若地上建筑物已依法取得规划许可、施工许可等手续，且农转用申请符合规划用途（如公益设施、基础设施等），则可依法办理农转用手续。此时建筑物可能被保留或按规划改造，但需补办土地用途变更登记。
若建筑物为违法建设（如未批先建、超占面积等）
根据《土地管理法》第七十七条，违法占用农用地建设的，需限期拆除或没收，并处罚款。此类情况下，必须先拆除违法建筑物、恢复土地原状，待土地符合农用地状态后，方可重新申请农转用。若强行以违法状态申请审批，将因程序违法被驳回。
特殊情形：历史遗留问题或政策性处理
部分地区对早期形成的、未完善手续但符合规划的建筑物（如农村宅基地超占、乡镇企业用地等），可能通过“补办手续+缴纳罚款”的方式纳入合法管理。此类情形需以地方政策为准，但核心原则仍是“先整改合法化，再申请农转用”。
关键提醒：农转用审批涉及土地性质变更，需严格遵循“规划先行、用途管制”原则。若您具体涉及某类建筑物（如宅基地、厂房、商业楼等）的农转用问题，建议提供建筑物性质、土地现状、规划用途等细节，我可进一步分析合规路径。