若案件资料未按时提交检察院，可能面临以下处理方式及建议：

1. 补充提交与说明
   若因疏忽或客观原因未及时提交资料，应第一时间联系检察院，说明未提交的原因（如资料整理延误、证据收集困难等），并尽快补交完整材料。根据《刑事诉讼法》规定，检察院审查案件时有权要求公安机关补充侦查，若属于此类情况，需配合补充材料以避免程序延误。

2. 程序性后果

   • 退回补充侦查：若资料缺失影响案件定性（如关键证据缺失），检察院可能将案件退回公安机关，要求补充侦查（期限通常为1个月，可退回2次）。
     
   • 延长审查期限：根据《人民检察院刑事诉讼规则》，检察院审查案件期限一般为1个月，重大复杂案件可延长15日；若需补充材料，审查期限可重新计算。
     
   • 不起诉或起诉决定：若资料缺失导致证据不足，检察院可能作出存疑不起诉决定；若资料完整但情节轻微，可能作出酌定不起诉；若证据充分，则依法提起公诉。

3. 法律责任风险

   • 对办案人员：若因故意隐瞒或拖延提交资料导致程序违法，相关人员可能面临内部纪律处分（如警告、记过）。
     
   • 对当事人：若资料缺失导致关键证据灭失（如未及时固定证人证言），可能影响案件结果（如减轻处罚或无罪辩护空间）。
     

建议行动步骤：

1. 立即整理剩余资料，优先提交核心证据（如物证、书证、证人联系方式）；
   
2. 书面说明未提交原因及补交计划，附上证据清单；
   
3. 若涉及专业问题（如电子数据提取、鉴定意见），可委托律师协助审查资料合法性；
   
4. 关注检察院通知，及时配合补充侦查或听证程序。
   

提示：案件资料完整性直接影响司法程序效率与结果，务必重视。如有具体案件细节（如案件类型、未提交资料内容），可进一步向我咨询，我会结合法律条文与实务经验为你分析。