药品因修改说明书被厂家发公告停售，零售店若继续销售，可能面临行政处罚、民事赔偿及刑事责任（视情节严重程度而定），具体分析如下：

1. 行政处罚
   根据《中华人民共和国药品管理法》第九十八条，禁止生产、销售劣药，其中“未按照规定标明有效期或更改有效期的”“擅自添加防腐剂、辅料的”等情形均属于劣药范畴。若药品说明书修改涉及安全性、有效性等关键信息（如禁忌症、不良反应变更），零售店继续销售可能被认定为销售劣药。依据《药品管理法》第一百一十七条，销售劣药的，没收违法销售的药品和违法所得，并处违法销售药品货值金额十倍以上二十倍以下的罚款；情节严重的，责令停业整顿直至吊销药品经营许可证。
   此外，若零售店未及时关注厂家停售公告，未履行进货查验义务（如未核对药品最新说明书），还可能违反《药品经营质量管理规范》，面临警告、罚款等处罚。

2. 民事赔偿
   若消费者因使用修改说明书后的药品导致健康损害（如未注意新禁忌症引发不良反应），零售店可能因销售不符合安全标准的产品，依据《中华人民共和国民法典》第一千二百零三条承担侵权责任。消费者可要求赔偿医疗费、误工费等损失，若药品存在缺陷导致死亡或健康严重受损，还可能面临惩罚性赔偿。

3. 刑事责任（极端情况）
   若零售店明知药品说明书已修改且存在重大安全隐患（如新增严重不良反应），仍故意销售，导致多人健康受损或死亡，可能构成《中华人民共和国刑法》第一百四十二条规定的“生产、销售劣药罪”。根据情节轻重，可处三年以下有期徒刑或拘役，并处罚金；后果特别严重的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。

建议：零售店应立即下架相关药品，核对厂家公告及药品说明书更新情况，主动联系供应商或监管部门确认处理方案。若已销售，需保留进货记录、销售凭证，并配合调查。如有进一步疑问，可直接向我咨询药品监管、合规经营等法律问题。