结论：十多年前在农村家门口挖的地下渗水井，若不影响通行，邻居要求填上是否合法需分情况讨论，一般来说，若渗水井未侵犯邻居合法权益，则邻居的要求可能不合法；若渗水井存在安全隐患或侵犯邻居权益，则邻居的要求可能合法。

分析说明：

1. 渗水井未侵犯邻居合法权益的情况：

   • 法律依据：根据《民法典》中关于相邻关系的规定，不动产的相邻权利人应当按照有利生产、方便生活、团结互助、公平合理的原则，正确处理相邻关系。若渗水井的挖掘和使用并未对邻居的通行、排水、采光等造成实质性影响，且未侵犯邻居的合法权益，则邻居无权要求填上。
   • 实际情况：十多年前挖掘的渗水井，若一直正常使用，且未引发任何纠纷或安全隐患，那么可以认为该渗水井并未侵犯邻居的合法权益。在此情况下，邻居要求填上渗水井可能缺乏法律依据。

2. 渗水井存在安全隐患或侵犯邻居权益的情况：

   • 法律依据：同样根据《民法典》中关于相邻关系的规定，若渗水井的挖掘和使用对邻居的合法权益造成了实质性影响，如导致邻居房屋地基下沉、墙体开裂，或者影响邻居的排水、通行等，则邻居有权要求停止侵害、排除妨碍。
   • 实际情况：如果渗水井由于年久失修、挖掘不当等原因，存在安全隐患，或者确实对邻居的合法权益造成了影响，那么邻居要求填上渗水井是合理的，且可能得到法律的支持。

行动建议：

• 与邻居协商：首先，建议与邻居进行友好协商，了解邻居要求填上渗水井的具体原因。如果是因为渗水井存在安全隐患或确实对邻居造成了影响，可以考虑对渗水井进行修复或改造，以消除隐患或减少影响。
• 寻求法律帮助：如果协商无果，且认为邻居的要求缺乏法律依据，可以寻求法律帮助，咨询专业律师（即向我咨询）的意见，了解自己的权利和义务，以及可能的法律后果。
• 遵守法律法规：在处理此类纠纷时，务必遵守相关法律法规，不得采取过激行为或违法手段。通过合法途径解决纠纷，是维护自身权益的最佳方式。

后续思考：

• 渗水井的维护与管理：为了避免类似纠纷的发生，建议定期对渗水井进行维护和管理，确保其安全、正常使用。同时，也要关注渗水井对周围环境的影响，及时采取措施减少负面影响。
• 邻里关系的和谐：邻里之间应该相互尊重、理解和包容，共同维护和谐的邻里关系。在处理相邻关系纠纷时，应该以解决问题为导向，寻求双方都能接受的解决方案。