结论前置：和老公分居两年起诉离婚法院不同意，这并不意味着无法离婚。关键在于能否提供充分证据证明夫妻感情确已破裂，且分居是因感情不和导致并已持续满两年。若证据充分，即使对方不同意，法院在调解无效后仍可能判决离婚。
一、理解法院判决的依据
根据《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条的规定，夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。人民法院审理离婚案件时，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。其中，“因感情不和分居满二年”是判断感情是否破裂的重要情形之一。
二、收集证据证明分居及感情破裂
分居证据：
- 分居协议：如果双方曾签订过分居协议，这是最直接有力的证据，应明确分居的起始时间、原因等。
- 租房合同：若一方在外单独居住，租房合同可以证明居住的起始日期和地点。
- 居委会或物业证明：官方出具的居住情况证明，具有法律效力，可以证明双方分居的事实。
- 证人证言：邻居、朋友等的证词，可以作为辅助证据，证明双方分居的情况。
- 聊天记录、邮件：关于分居的电子数据，如微信聊天记录、电子邮件等，可以体现分居的意愿和实际情况。
感情破裂证据：
- 提供双方关于矛盾冲突、感情问题的沟通记录，如短信、邮件、录音等，证明双方感情确已破裂。
- 证明双方在分居期间未有和好尝试或共同生活的事实，如没有共同出行的记录、没有共同参加活动的照片等。
三、法院审理阶段及可能的结果
调解程序：
- 人民法院在审理离婚案件时，会首先进行调解，尝试促成双方和好或就离婚相关事宜达成一致。即使一方不同意离婚，也需参加调解。
审理判决：
- 认定感情破裂准予离婚：若有足够证据证明夫妻因感情不和分居满两年，法院通常认定夫妻感情确已破裂，根据《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条的规定，调解无效的，应准予离婚。
- 未认定感情破裂不准离婚：若证据不足或无法证明分居是因感情不和导致，法院可能认为夫妻感情尚未完全破裂，从而判决不准离婚。
特殊规定：
- 经人民法院判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
四、后续应对措施
判决不准离婚后的处理：
- 若法院判决不准离婚，原告在没有新情况、新理由的情况下，六个月内不得再次起诉离婚。但被告不受此限制，可在此期间提起离婚诉讼。
- 六个月后，原告可以再次起诉离婚，此时若能提供新的证据证明夫妻感情确已破裂，法院判决离婚的可能性通常会增大。
在等待期间的注意事项：
- 在等待再次起诉期间，双方仍处于婚姻关系存续状态，应继续收集能证明夫妻感情破裂的新证据。
- 避免发生可能影响法院对夫妻感情判断的行为，如频繁联系、共同出行等。
五、建议与提醒
- 保持冷静与理智：在整个离婚过程中，保持冷静和理智至关重要。避免过激行为或不当言论，以免对自己造成不利影响。
- 寻求专业帮助：离婚涉及复杂的法律问题，如财产分割、子女抚养权等。若遇到困难或疑问，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供针对性的法律帮助。
示例说明：假设你和老公因感情不和已分居两年，期间你独自在外居住，并保留了租房合同、居委会证明以及与老公关于分居的聊天记录等证据。在起诉离婚时，你可以将这些证据提交给法院，以证明夫妻感情确已破裂且分居满两年。若法院经过审理认为证据充分，调解无效后，很可能会判决你们离婚。
总结：和老公分居两年起诉离婚法院不同意并不意味着无法离婚。关键在于能否提供充分证据证明夫妻感情确已破裂且分居满两年。若证据充分，即使对方不同意，法院在调解无效后仍可能判决离婚。在整个过程中，保持冷静与理智，并寻求专业帮助是非常重要的。