核心结论：伤残鉴定结果出来后是否要扣除保险公司的18000元，不能一概而论，需结合保险合同条款、事故责任划分、赔偿项目及当地交强险分项限额规定综合判断。以下分情况说明：

1. 若18000元属于交强险“医疗费用赔偿限额”且已垫付

根据《机动车交通事故责任强制保险条例》及条款，交强险医疗费用赔偿限额为18000元（部分地区可能不同），用于赔偿伤者的医疗费、住院伙食补助费、营养费等。

• 若保险公司已在此限额内垫付18000元：伤残鉴定结果出来后，保险公司无需再从该限额中扣款，但需在死亡伤残赔偿限额（18万元）内赔偿伤残赔偿金、护理费、误工费等项目。
  
• 若未垫付：保险公司需在交强险范围内按实际损失赔偿，但总额不超过分项限额（医疗费18000元+死亡伤残18万元+财产损失2000元）。

2. 若18000元属于商业险“免赔额”或“自费药扣除”

部分商业三者险合同会约定免赔额（如绝对免赔率）或自费药不赔条款：

• 若合同明确约定免赔18000元：伤残鉴定后，保险公司可能从赔偿总额中扣除该部分，但需证明免赔条款已向投保人明确说明（否则可能因格式条款无效而不被支持）。
  
• 若涉及自费药：保险公司可能扣除医保外用药费用，但需提供用药合理性证明；若伤者能证明自费药为治疗必需，法院可能不支持扣除。

3. 若事故存在责任划分（如主次责任）

若伤者负部分责任（如30%），保险公司可能按责任比例赔偿：

• 交强险范围内：仍需全额赔偿（不分责），但超出部分由商业险按责任比例承担。
  
• 商业险范围内：若总损失为10万元，伤者负30%责任，则保险公司仅赔7万元；若合同约定免赔18000元，则可能从7万元中扣除（需结合具体条款）。

4. 关键行动建议

1. 核查保险合同：重点查看交强险条款、商业险免责条款及特别约定。
   
2. 核对赔偿项目：区分医疗费、伤残赔偿金等是否属于不同赔偿限额。
   
3. 协商或诉讼：若对扣除有异议，可要求保险公司出具扣除依据，或通过交警调解、法院诉讼解决。

提示：保险理赔涉及条款解释、证据固定等专业环节，建议提供保险合同、事故认定书、医疗票据等材料，以便进一步分析。如有疑问，可直接向我咨询具体案件情况。