结论：分包合同已经过业主单位三次审计确定结算价后，转包单位再进行审减是否合法，需根据具体情况判断，若合同中有明确约定允许转包单位再次审减，且该约定不违反法律法规强制性规定，则转包单位审减行为合法；若合同无此约定或约定违反法律法规，则转包单位审减行为不合法。以下从不同角度详细分析：

合同约定角度

1. 合同有明确约定：如果分包合同中明确规定了，在业主单位审计确定结算价后，转包单位仍有权进行进一步的审减，并且这种约定没有违反法律法规的强制性规定，那么转包单位进行审减就是合法的。因为合同是双方意思自治的体现，只要不违反法律、行政法规的强制性规定，就应当受到法律的保护。例如，合同中可能约定了“业主单位审计确定结算价后，转包单位有权在XX日内对结算价进行复核，如发现错误或遗漏，有权进行审减”，这样的约定就是有效的。
2. 合同无明确约定：如果分包合同中没有明确规定转包单位在业主单位审计确定结算价后还有权进行审减，那么转包单位擅自进行审减就可能构成违约。因为此时转包单位的行为超出了合同约定的范围，损害了分包单位的合法权益。分包单位可以依据合同法的相关规定，要求转包单位承担违约责任。

法律法规角度

1. 合法审减情形：如果转包单位的审减行为是基于合法的理由，如发现分包单位在结算过程中存在虚报、瞒报等违法行为，或者发现结算价计算错误等，那么转包单位的审减行为就是合法的。因为此时转包单位是在行使自己的监督权，以维护合同的公平性和正义性。
2. 违法审减情形：如果转包单位的审减行为没有合法的理由，只是出于单方面的利益考虑，如想要减少支付给分包单位的款项等，那么这种审减行为就是违法的。因为此时转包单位的行为违反了诚实信用原则，损害了分包单位的合法权益。分包单位可以依法向法院提起诉讼，要求转包单位承担相应的法律责任。

实际操作建议

1. 审查合同条款：分包单位在面对转包单位的审减行为时，首先应当审查分包合同的条款，看合同中是否有关于转包单位审减权的明确约定。
2. 收集证据材料：如果分包单位认为转包单位的审减行为不合法，应当积极收集相关证据材料，如结算凭证、审计报告、合同文本等，以证明自己的主张。
3. 寻求法律帮助：如果分包单位无法自行解决与转包单位之间的纠纷，可以寻求专业的法律帮助，向我咨询相关法律问题，以便更好地维护自己的合法权益。

在实际操作中，分包合同已经过业主单位多次审计确定结算价后，转包单位再进行审减的情况比较复杂。因此，建议分包单位在遇到此类问题时，及时咨询专业律师，以便更好地应对和解决纠纷。