核心结论：债务人和债权人协商好还款后，法院在不知情的情况下法拍了房子，这种情况属于执行程序可能存在瑕疵，债务人可以通过提出执行异议、申请执行回转或追究相关人员责任等途径来维护自身合法权益。以下是具体分析：
- 提出执行异议
- 法律依据：根据《中华人民共和国民事诉讼法》第二百三十二条，当事人、利害关系人认为执行行为违反法律规定的，可以向负责执行的人民法院提出书面异议。债务人在与债权人协商好还款后，法院却法拍了房子，这很可能违反了法律规定或者双方的协商约定，债务人作为利害关系人有权提出执行异议。
- 操作方式：债务人需要准备书面异议申请书，详细说明异议的事实和理由，例如已经与债权人达成还款协议、法院在未通知或未了解该情况的情况下进行拍卖等，并提供相关证据，如还款协议、沟通记录等，提交给负责执行的人民法院。法院会在收到异议申请后进行审查，并作出裁定。如果债务人对裁定不服，还可以在规定期限内向上一级人民法院申请复议。
- 申请执行回转
- 适用情形：如果法院的拍卖行为已经完成，且财产已经过户给买受人，但后来发现该执行行为存在错误，如债务人已经与债权人协商好还款，法院不应再进行拍卖，那么债务人可以申请执行回转。
- 法律依据：《中华人民共和国民事诉讼法》第二百三十三条规定，执行完毕后，据以执行的判决、裁定和其他法律文书确有错误，被人民法院撤销的，对已被执行的财产，人民法院应当作出裁定，责令取得财产的人返还；拒不返还的，强制执行。
- 操作方式：债务人需要先通过法律程序确认法院的拍卖行为存在错误，例如通过提出执行异议、申请再审等方式。一旦确认执行行为错误，债务人可以向法院申请执行回转，要求取得拍卖财产的买受人返还财产。如果买受人拒不返还，法院可以采取强制执行措施。
- 追究相关人员责任（若存在过错）
- 分析：如果法院在执行过程中存在过错，如未尽到合理的审查义务、未依法通知债务人等，导致债务人的财产被错误拍卖，债务人还可以考虑追究相关人员的责任。不过，这需要具体分析法院的执行行为是否存在过错以及过错的程度。
- 操作方式：债务人可以先向法院的监察部门或者上级法院反映情况，要求对相关人员的执行行为进行调查。如果调查结果显示相关人员存在过错，债务人可以根据具体情况，要求法院对相关人员进行内部处分，或者通过国家赔偿等方式来维护自己的合法权益。如果认为相关人员的行为构成犯罪，还可以向公安机关报案，追究其刑事责任。