在非机动车闯红灯被机动车撞，且车子被扣留的情况下，车辆何时可以归还，主要取决于事故调查的进展以及是否需要进一步收集证据。以下是对此问题的详细分析：
一、事故调查与车辆扣留的基本规定
根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，公安机关交通管理部门在处理交通事故时，有权扣留事故车辆，以便进行调查、检验、鉴定等工作。这是为了确保事故责任的准确认定，以及后续赔偿等问题的妥善处理。
二、车辆归还的具体时间
一般情况：
- 在事故调查清楚，且不需要进一步扣留车辆进行检验、鉴定的情况下，公安机关交通管理部门应当及时返还车辆。这通常意味着，一旦事故责任认定完毕，且没有其他需要扣留车辆的法定理由，车辆就可以归还给车主。
特殊情况：
- 如果事故情况复杂，需要进一步调查取证，或者车辆需要作为证据进行检验、鉴定，那么扣留车辆的时间可能会延长。在这种情况下，公安机关交通管理部门会按照法定程序进行，并在完成相关程序后及时返还车辆。
- 具体来说，如果需要对车辆进行检验、鉴定，那么扣留车辆的时间可能会受到检验、鉴定周期的影响。根据相关规定，检验、鉴定应当在二十日内完成；需要延期的，经设区的市公安机关交通管理部门批准可以延长十日。检验、鉴定周期确定时限内完成的，公安机关交通管理部门应当自检验报告、鉴定意见确定之日起五日内通知当事人领取扣留的事故车辆。
三、车主的权益与注意事项
车主权益：
- 车主有权要求公安机关交通管理部门及时返还车辆，特别是在事故调查清楚且无需进一步扣留车辆的情况下。
- 如果车主认为车辆被无故扣留或扣留时间过长，可以向公安机关交通管理部门提出申诉或咨询，了解具体情况并寻求解决方案。
注意事项：
- 车主应积极配合公安机关交通管理部门的调查工作，提供必要的证据和信息，以便尽快完成事故调查和车辆返还程序。
- 在车辆被扣留期间，车主应妥善保管好相关证件和手续，以便在车辆返还时能够顺利办理相关手续。
四、法律建议
- 及时了解事故调查进展：车主可以通过与公安机关交通管理部门保持联系，及时了解事故调查的进展情况，以便在车辆可以返还时及时办理相关手续。
- 保留相关证据：车主应保留好与事故相关的所有证据，包括事故现场照片、视频、证人证言等，以便在需要时提供给公安机关交通管理部门或法院作为证据使用。
- 咨询专业律师：如果车主对事故处理程序或车辆返还时间有疑问或不满，可以咨询专业律师以获取更详细的法律建议和帮助。不过，在此情况下，你已经直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供针对性的法律意见。
综上所述，车辆何时可以归还主要取决于事故调查的进展以及是否需要进一步收集证据。车主应积极配合调查工作，并保留好相关证据以便在需要时使用。如果有任何疑问或不满，可以直接向我咨询以获取更详细的法律建议和帮助。