关于农民工工资保证金异地保函是否违反规定的问题，这主要涉及到《保障农民工工资支付条例》以及中国银保监会办公厅关于做好农民工工资支付保函相关工作的通知（银保监办发[2020]32号）中的相关规定。

首先，根据《保障农民工工资支付条例》第三十二条的规定，工资保证金是可以用金融机构保函来替代的。这里的保函，按照银保监会的通知，是指银行业金融机构在其业务范围内，应施工总承包单位等企业的申请开立，并按照条例要求可用以替代工资保证金的保函。

然而，关于“异地保函”的问题，虽然直接的规定可能并未明确提及“异地”是否允许，但我们可以从保函的本质和目的来推断。保函的主要目的是为了确保农民工工资的支付，其核心在于保函的合法性和有效性，以及开立保函的金融机构的信誉和偿付能力。如果异地保函是由具有合法资质、信誉良好的金融机构开立，且保函内容符合《保障农民工工资支付条例》及相关通知的要求，那么从法律和监管的角度来看，这样的保函应该是被接受的。

但需要注意的是，实际操作中可能存在地方性的具体规定或要求。不同地区可能对保函的开立机构、保函格式、担保金额等有具体的规定或偏好。因此，如果施工总承包单位考虑使用异地保函，最好事先咨询并了解当地人力资源社会保障行政部门或相关行业工程建设主管部门的具体要求，以确保保函的合规性和有效性。

另外，如果施工总承包单位未按规定存储工资保证金或者未提供符合规定的金融机构保函（包括异地但不符合当地具体要求的保函），根据《保障农民工工资支付条例》第五十五条的规定，将可能面临责令限期改正、项目停工、罚款以及更严重的处罚，如限制承接新工程、降低资质等级、吊销资质证书等。

综上所述，农民工工资保证金异地保函本身并不直接违反规定，但需要确保保函的合法性、有效性以及符合当地的具体要求。建议施工总承包单位在使用异地保函前，充分了解并遵守当地的相关规定和要求。