关于农民工工资问题能否直接上法院，这确实是一个需要根据具体情况来判断的问题。以下是我为您详细梳理的解答：
一、可以直接向法院起诉的情形
持有工资欠条且不涉及其他劳动争议：
- 如果您手中有用人单位出具的工资欠条，并且您的诉讼请求仅仅是要回拖欠的工资，不涉及劳动关系的其他争议（比如未签订劳动合同的双倍工资、加班费、经济补偿金等），那么您可以直接向法院提起诉讼。法院会按照普通民事纠纷来受理您的案件。
- 实例：假设您为包工头工作，包工头给您出具了明确写明欠薪金额和还款日期的工资欠条。如果到期未支付，您可以直接持该欠条向法院起诉，法院会按普通民事案件处理。
达成调解协议且用人单位不履行：
- 如果您与用人单位就拖欠工资问题达成了调解协议，但用人单位在协议约定期限内没有履行，那么您可以持调解协议书依法向人民法院申请支付令。法院会依法发出支付令，要求用人单位支付拖欠的工资。
- 实例：比如您与所在公司就拖欠工资问题达成了调解协议，但公司未按期履行。这时，您可以持调解协议书向法院申请支付令。
二、不能直接向法院起诉的情形
- 涉及劳动关系其他争议：
- 如果您的工资问题不仅仅是要回拖欠的工资，还涉及劳动关系的其他争议（比如未签订劳动合同的双倍工资、加班费、经济补偿金、违法解除劳动合同的赔偿金等），那么您需要先向劳动争议调解委员会申请调解；调解不成，再向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。对仲裁裁决不服的，您才可以向人民法院提起诉讼。劳动仲裁是劳动争议案件的前置程序。
- 实例：假设您不仅被拖欠工资，还认为公司未与您签订劳动合同应支付双倍工资。这种情况下，您需要先向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，对仲裁结果不服的，方可向法院起诉。
三、综合分析与建议
农民工工资问题涉及的法律程序可能较为复杂，具体能否直接上诉到法院需根据个案情况和相关法律法规来判断。在实际操作中，我建议您：
首先尝试与用人单位协商解决：很多时候，通过友好的协商可以更快地解决问题，避免不必要的法律纠纷。
根据具体情况选择合适的解决途径：如果您持有工资欠条且不涉及其他劳动争议，可以直接向法院起诉；如果达成调解协议但用人单位不履行，可以申请支付令；如果涉及劳动关系其他争议，则需要先申请劳动仲裁。
咨询专业律师：如果您对法律程序不熟悉或者遇到复杂的法律问题，建议咨询专业律师以获取更准确的法律意见和指导。律师可以帮助您分析案情、制定策略，确保您的合法权益得到有效维护。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。