结论：破产重整期间，债务人签订合同约定仲裁条款并不违反破产专属管辖原则。以下从多个角度进行详细分析：
一、破产专属管辖原则概述
破产专属管辖原则是指破产案件由债务人住所地人民法院管辖，这是为了确保破产程序的集中、统一和高效进行。然而，这一原则主要适用于破产程序中的核心事务，如破产申请的受理、破产宣告、债权人会议的召开等，并不涵盖债务人在破产重整期间签订的所有合同纠纷。
二、仲裁条款的性质与效力
仲裁条款是合同双方当事人约定将合同争议提交仲裁机构进行裁决的条款。根据《中华人民共和国仲裁法》的规定，仲裁条款具有独立性，即合同无效、被撤销或者终止的，不影响仲裁条款的效力。这意味着，即使合同本身因破产重整等原因而发生变化，仲裁条款仍然有效，双方当事人仍需按照仲裁条款的约定将争议提交仲裁机构裁决。
三、破产重整期间签订合同约定仲裁条款的合法性
不违反破产专属管辖原则：破产专属管辖原则主要针对的是破产程序中的核心事务，而仲裁条款涉及的是合同纠纷的解决方式。在破产重整期间，债务人仍然具有民事主体资格，有权签订合同并约定争议解决方式。因此，债务人签订合同约定仲裁条款并不违反破产专属管辖原则。
符合仲裁法的规定：根据《中华人民共和国仲裁法》的规定，平等主体的公民、法人和其他组织之间发生的合同纠纷和其他财产权益纠纷，可以仲裁。在破产重整期间，债务人与其他主体签订的合同纠纷属于仲裁法的调整范围，双方当事人可以约定仲裁条款。
有利于破产重整程序的顺利进行：在破产重整期间，债务人需要与众多债权人、投资人等进行协商和谈判，以达成重整计划。如果合同纠纷能够通过仲裁方式快速、公正地解决，将有利于破产重整程序的顺利进行，保护各方当事人的合法权益。
四、实际操作中的注意事项
虽然破产重整期间债务人签订合同约定仲裁条款并不违反破产专属管辖原则，但在实际操作中仍需注意以下几点：
确保仲裁条款的明确性和有效性：双方当事人在签订合同时，应明确约定仲裁条款的内容，包括仲裁机构、仲裁规则、仲裁地点等，以确保仲裁条款的有效性和可执行性。
考虑破产重整程序的特殊性：在破产重整期间，债务人的财产和事务可能受到法院的严格监管。因此，在签订合同时，应充分考虑破产重整程序的特殊性，避免因合同纠纷而影响破产重整程序的顺利进行。
及时与法院和破产管理人沟通：在破产重整期间，债务人应及时与法院和破产管理人沟通合同签订和争议解决方式的情况，以确保破产重整程序的透明度和公正性。
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