关于巨额财产来源不明罪中退差额的问题，首先需明确的是，该罪名的核心在于国家工作人员无法说明其明显超过合法收入的财产来源合法性，而非直接涉及退还差额的具体操作流程。不过，从法律后果和实际操作的角度，可以对此进行如下分析：
法律后果中的差额追缴：
- 根据《中华人民共和国刑法》第三百九十五条的规定，国家工作人员的财产、支出明显超过合法收入，差额巨大的，且不能说明来源的，差额部分以非法所得论，并会依法予以追缴。这意味着，在司法机关认定构成巨额财产来源不明罪后，差额部分将作为非法所得被国家追缴，而非由行为人主动“退还”。
追缴差额的具体操作：
- 追缴差额通常是在刑事判决生效后，由司法机关（如法院或执行机关）根据判决内容，对行为人的财产进行查封、扣押、冻结等措施，并最终将差额部分上缴国库。这一过程是司法机关的职权行为，行为人需配合执行，但无需自行操作退还差额。
行为人的配合义务：
- 虽然行为人无需自行退还差额，但在司法机关调查过程中，行为人有义务如实说明财产来源，提供相关证据或线索。若行为人拒绝说明或无法提供合法来源说明，将构成巨额财产来源不明罪的构成要件之一，并面临相应的刑事处罚。
特殊情况下的处理：
- 若行为人在司法机关调查前或调查过程中，主动向相关部门说明财产来源，并经查证属实，且该来源合法，则可能不构成巨额财产来源不明罪。此时，自然也无需追缴差额。
- 若行为人虽无法说明全部财产来源，但能说明部分来源合法，且该部分合法收入足以覆盖其部分财产或支出，则司法机关在追缴差额时，可能会扣除该部分合法收入对应的财产或支出。
法律建议：
- 对于涉嫌巨额财产来源不明罪的行为人，建议尽快咨询专业律师，了解自身权利和义务，积极配合司法机关的调查工作。
- 在调查过程中，如实说明财产来源，提供相关证据或线索，以争取从轻或减轻处罚。
- 若对司法机关的认定或处理有异议，可依法提出申诉或上诉，维护自身合法权益。
可能面临的法律后果：
- 若构成巨额财产来源不明罪，将面临五年以下有期徒刑或者拘役的刑罚；若差额特别巨大，则将受到五年以上十年以下有期徒刑的处罚。同时，财产的差额部分将依法予以追缴。
总结来说，巨额财产来源不明罪中并不直接涉及行为人主动退还差额的问题，而是由司法机关在认定构成犯罪后，依法追缴差额部分。行为人应积极配合司法机关的调查工作，如实说明财产来源，以维护自身合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。