财产损害赔偿纠纷和合同运输并不一样，它们是两种不同的法律关系。下面我将从多个角度为你详细分析：
一、法律关系性质
财产损害赔偿纠纷：这通常指的是因一方当事人的过错或法律规定的其他原因，导致另一方当事人的财产权益受到损害，从而引发的赔偿纠纷。这种纠纷可能涉及侵权、违约等多种法律关系，但核心在于财产权益的损害和赔偿。
合同运输：这则是指承运人与托运人之间，根据运输合同，承运人负责将托运人的货物从起运地点运输到约定地点，托运人支付运输费用的法律关系。合同运输主要涉及的是运输合同的履行、违约责任等法律问题。
二、纠纷产生的原因
财产损害赔偿纠纷：可能由多种原因引发，如交通事故导致的财产损失、产品质量问题导致的财产损害、环境污染导致的财产损失等。这些纠纷的焦点在于确定损害事实、损害程度以及赔偿责任。
合同运输纠纷：则主要围绕运输合同的履行产生，如承运人未按约定时间运输货物、货物在运输过程中损坏或丢失、托运人未支付运输费用等。这些纠纷的焦点在于合同的履行情况、违约责任的承担等。
三、法律适用和解决方式
财产损害赔偿纠纷：在法律适用上，可能涉及侵权责任法、合同法、产品质量法、环境保护法等多部法律。解决方式通常包括协商、调解、仲裁和诉讼等。
合同运输纠纷：在法律适用上，主要依据运输合同的具体条款以及合同法等相关法律规定。解决方式同样包括协商、调解、仲裁和诉讼，但更侧重于合同条款的解读和履行情况的审查。
四、实际案例说明
假设一个场景：一辆货车在运输途中发生交通事故，导致托运的货物受损。如果托运人选择以财产损害赔偿为由起诉承运人，那么这起纠纷就属于财产损害赔偿纠纷，焦点在于确定损害事实和赔偿责任。而如果托运人选择以合同运输纠纷为由起诉承运人，那么纠纷的焦点则在于承运人是否违反了运输合同的约定，以及应承担何种违约责任。
总结与建议：
财产损害赔偿纠纷和合同运输在法律关系性质、纠纷产生的原因、法律适用和解决方式等方面都存在显著差异。如果你遇到了相关纠纷，建议首先明确纠纷的性质和焦点，然后选择合适的法律途径进行解决。如果你有任何法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供专业的法律建议。