公司不可以以综合工资的形式不发加班费。以下从多个角度为你详细分析：

一、法律明确规定加班费支付义务

根据我国《劳动法》及相关法律法规，用人单位在安排劳动者加班时，必须按照以下标准支付加班工资：

1. 延长工作时间：支付不低于工资的150%的工资报酬。
2. 休息日工作且不能补休：支付不低于工资的200%的工资报酬。
3. 法定休假日工作：支付不低于工资的300%的工资报酬。

这些规定是强制性的，确保了劳动者在付出额外劳动后能够获得相应的经济补偿，是企业必须履行的法律责任。综合工资并不构成企业拒发加班费的合法理由，企业不能通过将加班费包含在综合工资中的方式，来规避支付加班费的义务。

二、工时制度与加班工资的适用性

我国的工时制度主要包括标准工时制、综合计算工时制和不定时工时制。对于不同工时制度下的加班工资支付情况，具体如下：

• 标准工时制与综合计算工时制：在这两种工时制度下，劳动者依法享有加班工资的权利。即使企业采用综合计算工时制，也需要在综合计算周期内，按照上述加班工资支付标准，对劳动者超出法定工作时间的部分支付加班费。
• 不定时工时制：需经劳动行政部门批准后实施。在不定时工作制下，除法定节假日工作外，其他时间工作通常不视为加班，因此不存在加班工资的问题。但企业需确保符合不定时工作制的法定程序和条件，且这一制度并不适用于所有岗位和劳动者。

三、加班工资的计算方法与综合工资的关系

在标准工时制下，加班工资的计算基于日工资，而日工资则根据月工资收入和月计薪天数来确定。月计薪天数一般按（365天-52周×2天）÷12月=21.75天计算，日工资则为月工资收入除以21.75天。这一计算方法为加班工资的具体数额提供了明确的依据。

综合工资通常指的是劳动者在一定时期内（如一个月）所获得的全部工资性收入，包括基本工资、奖金、津贴等。然而，综合工资并不等同于已经包含了加班费的工资。除非企业与劳动者在劳动合同中明确约定了综合工资中包含加班费的具体数额和计算方式，且该约定不违反法律法规的强制性规定，否则企业不能单方面以综合工资为由拒发加班费。

四、劳动者权益保护与法律责任

1. 权益保护：如果劳动者能够证明存在加班事实，但企业未支付相应的加班费，劳动者有权要求企业补发加班费。在协商无果的情况下，劳动者可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
2. 法律责任：根据《劳动法》的相关规定，企业若安排加班而不支付加班费，将面临以下法律责任：
   • 由劳动行政部门责令限期支付加班费；
   • 逾期不支付的，将责令企业按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金。

建议：作为劳动者，在签订劳动合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于工资和加班费的约定。如果发现企业存在拒发加班费的情况，应及时收集证据（如加班记录、工资条等），并通过合法途径维护自己的权益。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。