元旦请假扣工资是否合法，需分情况讨论：
- 元旦属于法定节假日，依法享受带薪休假
根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条的规定，元旦作为法定节假日，劳动者在法定休假日期间，用人单位应当依法支付工资。这意味着，如果劳动者在元旦当天请假（且该请假未超出法定休假天数，即元旦当天），用人单位是不应扣除其工资的。因为这一天劳动者本就享有带薪休假的权利。
若元旦请假包含调休日或超出法定休假天数，则需根据具体情况判断
- 调休日请假：如果元旦假期中包含了调休日（即原本为工作日，因元旦假期而调整为休息日），劳动者在调休日请假，用人单位可能会根据内部规章制度或劳动合同约定，决定是否扣除工资。但这种情况下的扣除需合理且合法，不能违反劳动法律法规的强制性规定。
- 超出法定休假天数请假：如果劳动者在元旦假期基础上额外请假（即超出了元旦当天的法定休假天数），那么对于超出的部分，用人单位可能会根据内部规章制度或劳动合同约定，按照事假、病假等不同情况扣除相应工资。但同样，这种扣除需遵循合法、合理的原则。
用人单位规章制度或劳动合同的约定
除了上述法定情形外，用人单位的内部规章制度或劳动合同中也可能对请假扣工资的事项作出具体规定。如果这些规定不违反法律法规的强制性规定，且劳动者在签订劳动合同时已明确知晓并同意，那么这些规定将作为判断请假扣工资是否合法的依据之一。但需要注意的是，任何规章制度或劳动合同条款都不得违反法律法规的强制性规定，否则将被视为无效。
法律建议：
- 如果劳动者在元旦当天请假且被扣除工资，可以首先查阅用人单位的规章制度或劳动合同，确认是否存在相关扣除条款。
- 如果规章制度或劳动合同中未明确规定或规定违反法律法规，劳动者可以与用人单位协商解决；协商不成的，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
可能后果：
- 如果用人单位在元旦当天扣除劳动者工资且无法提供合法依据，可能面临劳动监察部门的处罚，包括责令改正、罚款等。
- 劳动者也可能因此解除与用人单位的劳动合同，并要求用人单位支付经济补偿金。
总之，元旦请假扣工资是否合法需根据具体情况判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。