因员工个人原因，双方协商一致解除劳动关系本身并不违法，但具体是否违法需根据协商的内容和过程来判断。以下从不同角度为你详细分析：
一、协商一致解除劳动关系的合法性基础
根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者协商一致，可以解除劳动合同。这是法律赋予双方的一种合法解除劳动关系的方式。因此，从这一层面来说，因员工个人原因，双方协商一致解除劳动关系是合法的。
二、协商过程中需注意的合法性要点
协商内容合法：
- 双方在协商过程中，应确保协商的内容不违反法律法规的强制性规定，不损害国家、集体或第三人的利益。例如，不能通过协商来规避用人单位应承担的法定义务，如支付经济补偿、缴纳社会保险等。
协商过程合法：
- 协商过程应遵循公平、自愿、诚实信用的原则。用人单位不得利用优势地位强迫劳动者接受不合理的条件，劳动者也不得通过欺诈、胁迫等手段迫使用人单位同意解除劳动关系。
书面协议：
- 为了保障双方的权益，建议双方在协商一致后签订书面协议，明确解除劳动关系的时间、原因、经济补偿等事项。这有助于避免后续因口头协议而产生的纠纷。
三、可能存在的违法情形及后果
未支付经济补偿：
- 如果因用人单位的原因导致劳动关系解除，且用人单位未按照法律规定支付经济补偿，那么这种协商一致解除劳动关系的行为可能因违反法律规定而无效。劳动者有权要求用人单位支付经济补偿，并可能因此向劳动仲裁机构或法院提起诉讼。
违反法定程序：
- 如果用人单位在解除劳动关系时未按照法定程序进行，如未提前通知劳动者、未听取劳动者的意见等，那么这种协商一致解除劳动关系的行为也可能因违反法定程序而无效。劳动者有权要求用人单位继续履行劳动合同或支付赔偿金。
四、建议与措施
在协商过程中保持谨慎：
- 双方在协商过程中应充分了解自己的权益和义务，确保协商内容合法、合理。如有需要，可以寻求专业律师的帮助，以确保自己的权益得到保障。
签订书面协议：
- 双方在协商一致后，应签订书面协议，明确解除劳动关系的相关事项。这有助于避免后续纠纷的发生，并保障双方的权益。
及时咨询专业律师：
- 如果在协商过程中遇到任何疑问或困惑，建议及时咨询专业律师。律师可以根据具体情况提供专业的法律意见和建议，帮助双方更好地解决问题。
如有任何劳动工伤（劳动仲裁）方面的法律问题，都可以直接向我咨询，我会为你提供专业、全面的解答。