结论：您收取这一千元赔偿是否违法，取决于多个因素，包括盗窃者的行为性质、您与盗窃者之间的协商情况以及这一千元赔偿的性质。下面我将从不同角度为您详细分析。

1. 若盗窃者构成盗窃罪，且您收取的是民事赔偿

• 法律背景：根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，盗窃公私财物，数额较大的，或者多次盗窃、入户盗窃、携带凶器盗窃、扒窃的，构成盗窃罪。若盗窃者的行为构成盗窃罪，您作为受害者，有权要求其赔偿您的损失。
• 赔偿性质：在这种情况下，您收取的一千元可以视为盗窃者对您的民事赔偿，用于弥补您因盗窃行为所遭受的损失（如木料的价值、因盗窃导致的其他直接损失等）。
• 法律后果：只要这一千元赔偿是合理且双方自愿协商达成的，您收取这一千元并不违法。它属于民事赔偿范畴，是盗窃者对其犯罪行为所应承担的民事责任的一部分。

2. 若盗窃者不构成盗窃罪，但您与其协商达成赔偿

• 法律背景：如果盗窃者的行为尚未达到构成盗窃罪的程度（如盗窃的木料价值较低，不属于“数额较大”），但您与其进行了协商，并达成了一千元赔偿的协议。
• 赔偿性质：在这种情况下，这一千元赔偿可以视为双方之间的民事和解协议的一部分。它旨在解决因盗窃行为引起的民事纠纷，避免进一步的法律冲突。
• 法律后果：只要这一千元赔偿是双方自愿、公平、合理达成的，且没有违反法律法规的强制性规定，您收取这一千元同样不违法。它属于民事和解的范畴，是双方对各自权利义务的处分。

3. 需要注意的特殊情况

• 敲诈勒索的风险：如果您在抓住盗窃者后，利用其恐惧心理或不利地位，强行要求其支付远超过实际损失的一千元作为“赔偿”，甚至威胁要报警或采取其他法律行动除非其支付，这种行为可能构成敲诈勒索。敲诈勒索是违法行为，会受到法律的制裁。
• 赔偿金额的合理性：无论盗窃者是否构成盗窃罪，您收取的赔偿金额都应当合理且与实际损失相符。如果赔偿金额明显过高或过低，都可能引发法律纠纷或质疑。

建议：

• 在处理此类情况时，建议您保持冷静和理性，与盗窃者进行公平、合理的协商。
• 如果可能的话，可以邀请第三方（如警方、社区工作人员等）作为见证人，以确保协商过程的公正性和合法性。
• 如果您对赔偿金额或协商过程有任何疑问或担忧，建议及时咨询专业律师以获取法律建议和支持。

总之，您收取这一千元赔偿是否违法取决于多个因素。只要您确保赔偿是合理、自愿且合法的，就可以放心收取。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。