针对您提出的问题，即公司需要二类资质并要求员工提供身份证和学历证是否合理，我们可以从以下几个方面进行详细分析：

首先，我们要明确的是，任何单位和个人都没有权利扣留他人证件原件。这是根据《劳动合同法》的明确规定，用人单位在招用劳动者时，不得扣押劳动者的居民身份证和其他证件，也不得要求劳动者提供担保或者以其他名义向劳动者收取财物。这一规定旨在保护劳动者的合法权益，防止用人单位利用证件扣押等手段对劳动者进行不正当的控制或剥削。

对于公司需要二类资质的情况，这通常与公司的业务范围、经营资质或特定项目的需求有关。然而，这并不意味着公司可以要求员工提供身份证和学历证的原件作为资质申请的一部分。资质申请通常应基于公司自身的条件、能力、业绩等方面进行，而不是依赖于员工的个人证件。

如果公司确实需要员工提供相关证件以进行某种形式的验证或备案，那么员工仅需向有关人员出示证件即可，或者提供证件的复印件或影印件。在提供复印件或影印件时，员工应记得在合适位置注明具体用途，以防止证件被滥用。

此外，我们还要警惕一些公司可能存在的“扣证件”行为，即借保管或经办社会保险、申办工资卡等业务名义，扣押求职者身份证、毕业证、学位证等个人证件原件。这种行为是典型的求职陷阱，遇到这种情况，员工应果断拒绝，并向劳动监察部门举报。

综上所述，公司要求员工提供身份证和学历证的原件作为二类资质申请的一部分是不合理的，也是违法的。员工应保护好自己的个人证件，避免被不法分子利用。如果公司确实需要员工提供相关证件进行验证或备案，员工应仅提供复印件或影印件，并注明具体用途。同时，员工也应了解自己的合法权益，遇到侵权情况及时投诉举报。