关于房屋租赁合同中约定发票税点由承租人承担是否合法的问题，这并非一个绝对非法或合法的简单判断，而是需要结合具体合同条款、相关法律法规以及实际操作情况来综合分析。
一、从法律法规角度分析
纳税义务人：
- 根据我国税收相关法律法规，如《房产税暂行条例》等，房屋租赁涉及的税种（如营业税、房产税等）的纳税义务人通常是出租方，即产权所有人。这意味着，从法定纳税义务层面来看，承租人并非法定的纳税主体。
合同约定的效力：
- 然而，《中华人民共和国民法典》强调意思自治原则，允许合同双方在平等自愿的基础上就相关事项进行约定。因此，如果房屋租赁合同中明确约定了发票税点由承租人承担，并且这一约定不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，那么该约定在合同法层面是合法有效的。
税务法规的考量：
- 尽管合同可以约定税费的承担方式，但税务法规对纳税义务人和发票开具方有明确规定。出租方作为法定纳税义务人，仍需履行其纳税义务，包括按时申报、缴纳税款等。同时，发票应由出租方开具，除非承租方符合税务机关规定的代开发票条件，并通过合法途径代开。
二、从实际操作角度分析
协商与约定：
- 在实际操作中，房屋租赁税费的承担方式可以通过合同双方协商确定。如果双方在合同中明确约定了由承租人承担发票税点，并且这一约定符合法律法规的要求，那么承租人应当按照约定承担相应的税费。
承租人的权益保护：
- 承租人在签订合同时应仔细阅读合同条款，了解自己的权利和义务。如果认为税费承担方式不合理或存在其他争议，承租人可以通过法律途径来维护自己的权益，如寻求法律援助、向法院提起诉讼或向相关部门投诉等。
合法操作的重要性：
- 无论合同如何约定，双方都必须确保税费缴纳的合法性和发票开具的真实性、合法性。承租人不得以非法手段获取发票或逃避纳税义务，否则将面临法律责任。
三、总结与建议
合法性判断：
- 房屋租赁合同中约定发票税点由承租人承担，在合同法层面是可能合法的，但前提是必须遵守相关法律法规和税务机关的规定。
明确约定：
- 为避免后续产生纠纷和争议，建议在签订租赁合同时，双方应充分协商并明确税费的承担方式、发票的开具方式等关键条款。
咨询专业意见：
- 如果双方对税费承担或发票开具方式有疑问或争议，应及时咨询相关部门或法律专业人士的意见，以确保合同条款的合法性和公平性。
综上所述，房屋租赁合同中约定发票税点由承租人承担并非绝对不合法，但必须严格遵守相关法律法规和税务机关的规定。在签订合同时，双方应充分协商并明确相关条款，以确保合同的合法性和公平性。