二手车转让仅有协议在符合一定条件下是合法的，但为了确保交易安全，建议尽快办理过户手续。以下是对这一问题的详细分析：

一、协议合法性的条件

根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，一个有效的民事法律行为（包括二手车买卖协议）必须满足以下条件：

1. 行为人具有相应的民事行为能力：买卖双方需为具备完全民事行为能力的自然人、法人或其他组织。例如，年满18周岁且精神正常的成年人所签订的二手车买卖协议通常符合此要求。
2. 意思表示真实：双方在签订协议时必须出于自愿，不存在欺诈、胁迫等情形。卖家应如实告知车辆的真实状况，买家则基于真实意愿决定购买。
3. 不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗：协议内容必须合法，不能涉及非法车辆（如被盗抢或走私车辆）的交易，也不能用于违法犯罪活动等违背公序良俗的用途。

只要二手车买卖协议符合上述条件，即使未立即办理车辆过户登记手续，该协议本身也是具有法律效力的。双方均应按照协议约定履行各自义务，否则将构成违约并承担相应的法律责任。

二、特殊情况下的协议无效性

然而，在某些特殊情况下，二手车买卖协议可能会被认定为无效：

• 车辆来源不合法：若车辆系通过盗窃、抢劫等非法手段获得，或属于走私车等非法渠道车辆，则相关买卖协议无效。
• 以合法形式掩盖非法目的：如双方签订车辆买卖协议实际上是为了逃避债务或进行其他非法活动，则该协议可能被认定无效。
• 违背公序良俗：若协议内容违反社会公德或公共秩序，如约定车辆用于违法犯罪活动，则协议无效。

三、过户手续的重要性

尽管二手车买卖协议在符合上述条件下有效，但办理车辆过户手续对于确保交易双方的权益至关重要。车辆所有权的转移以交付为要件，但对抗善意第三人则以登记为准。这意味着，虽然交付车辆后买家即取得所有权，但若未办理过户登记手续，则无法有效对抗未来可能出现的善意第三人主张权利的情况。例如，如果卖家在车辆交付后仍以车主身份将车辆抵押或出售给第三方，且该第三方为善意取得，则买家可能面临车辆被追回的风险。

四、建议

为了确保二手车交易的合法性和安全性，建议双方在签订协议后尽快办理过户手续。同时，在签订协议前，双方应仔细核对车辆信息、交易条款等关键内容，确保协议内容完整、准确、无遗漏。如有需要，可以咨询专业律师或相关机构以获取更详细的法律建议和指导。

如果您在二手车交易过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。