业主单位聘请第三方工程造价咨询单位是合法的。以下从多个角度对此问题进行详细分析：

一、法律层面

在建设工程领域，业主单位为了准确掌握工程造价，确保工程投资的合理性和有效性，常常会聘请具有专业资质的第三方工程造价咨询单位进行工程造价的审核和评估。这种做法在法律上是被允许的，并且受到相关法律法规的保护。例如，《中华人民共和国建筑法》以及《工程造价咨询企业管理办法》等法律法规，均未禁止业主单位聘请第三方进行工程造价咨询，反而通过规范工程造价咨询企业的行为，保障了工程造价咨询的合法性和准确性。

二、实际操作层面

1. 选择资质合格的咨询单位：业主单位在聘请第三方工程造价咨询单位时，应确保所选单位具备相应的工程造价咨询资质，这是保证咨询结果合法性和准确性的前提。
2. 签订咨询合同：业主单位与第三方工程造价咨询单位应签订详细的咨询合同，明确双方的权利和义务，包括咨询范围、咨询费用、咨询期限等关键条款。
3. 咨询过程透明化：在咨询过程中，业主单位应要求咨询单位提供详细的咨询报告，包括工程造价的详细计算过程、依据和结论等，以便业主单位对咨询结果进行审查和确认。

三、风险防控层面

1. 审核咨询单位资质：业主单位在聘请前应对咨询单位的资质进行严格审核，避免聘请无资质或资质不符的单位进行咨询。
2. 明确咨询范围和责任：在咨询合同中，应明确咨询单位的咨询范围和责任，避免咨询单位因超出咨询范围或未履行咨询责任而给业主单位带来损失。
3. 保留相关证据：业主单位应妥善保管与咨询单位之间的往来文件、咨询报告等证据材料，以便在发生纠纷时能够提供有力的证据支持。

四、可能遇到的法律问题及应对

1. 咨询结果不准确：如果咨询单位提供的咨询结果存在重大误差或错误，业主单位有权要求咨询单位进行更正或重新咨询。如果因此给业主单位造成损失的，咨询单位应承担相应的赔偿责任。
2. 咨询单位违约：如果咨询单位在咨询过程中违反合同约定或法律法规的规定，业主单位有权要求咨询单位承担违约责任或依法追究其法律责任。

业主单位聘请第三方工程造价咨询单位是合法且可行的做法。在实际操作中，业主单位应选择资质合格的咨询单位、签订详细的咨询合同、确保咨询过程透明化，并做好风险防控工作。如果您在建设工程领域遇到任何法律问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。