结论：合伙人用您的营业执照办理健康证，并不能直接将其视为您的职员。这种行为可能涉及多个法律问题，包括但不限于营业执照的借用、健康证的办理与使用，以及劳动关系的认定等。

详细分析：

1. 营业执照的借用问题：

   • 营业执照是企业合法经营的凭证，不得随意出借或转让。如果合伙人未经您同意，擅自使用您的营业执照办理健康证，这可能构成对营业执照的非法使用，违反了相关法律法规。
   • 根据《中华人民共和国公司法》及相关规定，营业执照的借用、出租、出借等行为都是被禁止的，并可能面临行政处罚，如罚款、吊销营业执照等。

2. 健康证的办理与使用：

   • 健康证是从事特定行业（如食品、餐饮等）的工作人员必须持有的证件，用于证明其身体健康状况符合从事该行业的要求。
   • 如果合伙人使用您的营业执照办理健康证，但并非以您的名义或代表您的企业从事相关活动，那么这种健康证的使用可能是无效的，甚至可能构成欺诈行为。

3. 劳动关系的认定：

   • 职员是指与企业建立劳动关系，为企业提供劳动并获取报酬的人员。劳动关系的认定通常基于双方是否存在雇佣关系、是否签订劳动合同、是否支付工资等因素。
   • 仅仅因为合伙人使用了您的营业执照办理健康证，并不能直接认定其为您的职员。要确定劳动关系，需要考察双方是否存在实际的雇佣关系、是否签订了劳动合同、是否支付了工资等。

法律建议：

• 立即停止非法行为：如果合伙人确实未经您同意使用了您的营业执照办理健康证，您应立即要求其停止这种行为，并收回相关证件。
• 加强内部管理：作为企业主，您应加强对营业执照等重要证件的管理，防止被他人非法使用。同时，也应加强对企业员工的培训和管理，确保他们了解并遵守相关法律法规。
• 咨询专业律师：如果您对这种情况的处理存在疑问或担忧，建议咨询专业律师，以便更好地了解您的权利和义务，并采取适当的法律措施来保护您的企业利益。

可能后果：

• 如果合伙人使用您的营业执照办理健康证并从事非法活动，您可能因营业执照被非法使用而面临行政处罚或法律责任。
• 如果因此导致您的企业声誉受损或经济损失，您有权要求合伙人承担相应的赔偿责任。

总之，合伙人用您的营业执照办理健康证并不能直接将其视为您的职员。这种行为可能涉及多个法律问题，需要您谨慎处理。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。