结论：违法解除劳动合同后，经过两年协商期，是否可以返回起诉，这主要取决于具体的法律程序和时效规定。一般来说，若在协商期间未达成一致且未超过法定诉讼时效，是可以返回起诉的；但若已超过诉讼时效或协商期间已明确放弃诉讼权利，则可能无法再起诉。以下是对此问题的详细分析：
一、诉讼时效的考虑
一般诉讼时效：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间通常为三年。这意味着，在违法解除劳动合同的情况下，如果劳动者在三年内未提起诉讼，可能会因超过诉讼时效而丧失胜诉权。但需注意，此处提及的是民法典的一般规定，对于劳动争议案件，应优先适用劳动法律法规的特别规定。
劳动争议诉讼时效：根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。若劳动者在一年内未申请仲裁，则可能因超过仲裁时效而无法获得法律救济。然而，若劳动者在仲裁时效期间内已申请仲裁，且对仲裁裁决不服，则可以在收到仲裁裁决书之日起十五日内向人民法院提起诉讼。
二、协商期间的影响
协商期间不计入诉讼时效：在协商期间，如果双方正在积极协商解决争议，且劳动者能够证明其一直在主张权利，那么这段时间通常不会被计入诉讼时效期间。这意味着，即使协商持续了两年，只要劳动者在协商期间内或协商结束后及时提起诉讼，且未超过法定诉讼时效，其起诉权仍然受到保护。
协商结果的影响：如果双方在协商期间达成了和解协议，并且劳动者明确表示放弃诉讼权利，那么劳动者在后续可能无法再就同一争议提起诉讼。因此，在协商过程中，劳动者应谨慎考虑是否放弃诉讼权利，并确保和解协议的内容明确、合法。
三、实际操作建议
及时咨询专业律师：在面临违法解除劳动合同的情况时，劳动者应及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，以及可能的法律救济途径。
保留证据：劳动者应保留与违法解除劳动合同相关的所有证据，包括但不限于劳动合同、解除劳动合同的通知、工资单、工作记录等。这些证据在后续的法律程序中可能起到关键作用。
注意时效限制：劳动者应密切关注诉讼时效和仲裁时效的限制，确保在法定期间内提起诉讼或申请仲裁。如果因特殊原因无法及时提起诉讼或申请仲裁，劳动者应考虑向法院申请延长时效或采取其他合法措施保护自己的权益。
四、特殊情况说明
如果劳动者在协商期间内或协商结束后发现新的证据或事实，这些证据或事实可能对案件的判决产生重大影响，那么劳动者仍然有权在法定诉讼时效内提起诉讼或申请再审。但这种情况较为特殊，需要具体分析。
总结：违法解除劳动合同后经过两年协商期是否可以返回起诉，取决于多种因素，包括诉讼时效、协商期间的影响以及协商结果等。因此，我建议您在面临此类情况时，及时咨询专业律师并保留好相关证据，以便在必要时采取法律行动。如果您有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。