已签订的合同上写上“作废”是否有效，需根据具体情况综合判断。以下是对此问题的详细分析：
一、合同“作废”有效的情形
双方协商一致：
- 如果合同双方当事人都同意在已签字的合同上注明“作废”，并且这一行为没有其他违法或违背公序良俗的情形，那么这种注明可以视为双方对原合同的变更或解除的一种有效意思表示。此时，原合同自双方达成“作废”合意时起，对双方不再具有法律约束力。
- 关键点：双方不仅需要在合同上明确标注“作废”字样，还应有各方的签字确认，以体现双方对于取消原合同适用性的共同认可。
符合法律规定：
- 在某些特殊情况下，即使双方约定“作废”，也可能需要按照法律规定办理相应手续，如涉及公共利益、第三方合法权益等重要事项时，合同的“作废”才会产生完全的法律效力。例如，若合同涉及不动产的转让，可能需要办理过户登记手续后，合同的“作废”或变更才具有对抗第三人的效力。
二、合同“作废”无效的情形
一方擅自注明：
- 如果只有一方在已签字合同上单方面写作废，且没有取得对方的同意，那么这种注明通常是无效的。因为合同是双方当事人意思表示一致的产物，任何一方不得擅自变更或解除合同。
- 法律后果：擅自注明“作废”的一方可能构成违约，需承担违约责任，如赔偿对方因此遭受的损失。
存在违法行为：
- 如果合同的作废是出于逃避法律责任的目的，或者存在诸如欺诈、胁迫等违法行为，那么这样的作废声明也将被视为无效。
- 法律后果：不仅作废声明无效，还可能因违法行为而面临法律制裁，如罚款、拘留等。
影响合同履行：
- 若合同已经部分履行，那么作废的效力可能会受到影响。在这种情况下，即便双方达成了“作废”的合意，也可能需要根据实际履行情况来确定合同的最终效力。例如，若合同已部分履行且双方对已履行部分无争议，那么“作废”可能仅针对未履行部分。
三、特殊情况下的处理
- 涉及特殊法定程序或形式要求的合同：即使双方约定“作废”，也必须按照法律规定办理相应手续，才能确保合同的“作废”产生法律效力。例如，若合同涉及公司股权转让，可能需要办理工商变更登记手续。
- 合同涉及到公共利益、第三方合法权益等重要事项：仅仅在合同上标注“作废”字样可能无法彻底解除合同所蕴含的法律效力，还需要考虑其他法律因素和程序要求。例如，若合同涉及政府采购项目，可能需要经过政府相关部门的审批或备案。
四、建议与操作指南
- 书面协商：为避免法律风险，建议与对方重新签署解除协议或补充条款，明确约定原合同的废止时间及后续权利义务关系。
- 保留证据：确保所有协商过程均有书面记录，包括邮件往来、会议纪要或录音资料等，以备发生纠纷时作为证据使用。
- 法律咨询：在涉及重大利益调整时，建议提前咨询专业律师，确保操作符合《民法典》等相关法律法规的规定。
总结：判断已签字的合同上写明“作废”是否有效，不能简单地依据合同上的“作废”字样来认定。而是需要综合考虑双方当事人的意思表示、法律规定以及合同的实际履行情况等多个因素。只有在双方协商一致、符合法律规定且不影响合同履行的情况下，合同的“作废”才会被认定为有效。若您在此方面遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。