员工不愿上夜班是否合法，主要取决于劳动合同中的约定、相关法律法规的规定以及员工的个人特殊情况。以下是对此问题的详细分析：

1. 劳动合同中的约定

   • 明确约定上夜班：如果劳动合同中明确约定了员工需要上夜班，或者明确了工作时间包括夜间，那么员工通常应遵守合同约定，无权随意拒绝。因为劳动合同是双方自愿达成的协议，具有法律约束力。
   • 未明确约定上夜班：如果劳动合同中没有明确约定上夜班，或者约定的工作时间不是夜间，那么员工在未经协商一致的情况下，有权拒绝单位的夜班安排。因为用人单位不能单方面变更劳动合同内容，必须经双方协商一致并采用书面形式。

2. 法律法规的规定

   • 标准工时制度：根据《中华人民共和国劳动法》等相关法律法规，员工每日工作时间不超过8小时，每周工作时间不超过44小时（一般为40小时，但部分行业或地区可能有特殊规定）。如果夜班安排违反了这一限制，员工有权拒绝。例如，如果单位要求员工连续上夜班导致工作时间严重超标，员工可以依法拒绝。
   • 特殊工时制度：对于因生产特点不能实行标准工时制度的企业，经劳动行政部门批准，可以实行其他工作和休息办法，如不定时工作制或综合计算工时工作制。在这种情况下，只要符合法律规定的程序和要求，员工应服从合理的夜班安排。但即便如此，单位也需保障员工的基本休息权利，不能过度安排夜班。

3. 员工的个人特殊情况

   • 健康原因：如果员工因身体健康原因，如患有某些疾病或处于特殊生理时期（如孕期、哺乳期），经医疗机构证明不适宜上夜班，那么员工有权拒绝夜班安排。因为用人单位有义务提供安全的劳动环境，保障员工的身体健康。
   • 特殊人群保护：对于怀孕满7个月以上的女职工、处于哺乳期的女职工以及未成年工等特定人群，我国法律明确规定不得安排其从事夜间劳动。这些员工在符合相关条件时，有权拒绝上夜班。

法律建议：

• 如果员工不愿上夜班，首先应查看自己的劳动合同内容，了解是否有相关约定。
• 如果劳动合同中未约定上夜班，且夜班安排违反了法律法规或员工的特殊保护规定，员工可以拒绝夜班安排，并与单位进行沟通协商。
• 如果单位坚持要求员工上夜班，员工可以向劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁来维护自身合法权益。

可能后果：

• 如果员工的工作本身就属于夜间工作，且劳动合同中有明确约定，那么拒绝上夜班可能构成严重违反用人单位规章制度的行为，用人单位可以依法解除与员工的劳动合同。
• 在其他情况下，如果员工无正当理由拒绝上夜班，可能会面临用人单位的纪律处分或其他管理措施，如警告、罚款等。但这些措施必须合法合规，不能侵犯员工的合法权益。

综上所述，员工不愿上夜班是否合法，需要根据具体情况进行判断。如果员工遇到相关问题，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律建议。