合同中约定对方盖章签字后生效，这一条款本身在形式上并无问题，但合同的最终生效与否还需根据具体情况及法律规定来判断。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
一、通常生效情况
根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自双方均签名、盖章或按指印时，合同即成立。若法律、行政法规无特别规定，且当事人无特别约定，则合同自成立时起生效，对双方当事人具有法律约束力。因此，在合同中明确约定“盖章签字后生效”，且双方均按照约定完成了盖章和签字，同时合同内容不违反法律、行政法规的强制性规定，也不违背公序良俗，那么合同通常是会生效的。
二、特殊情形下可能不生效的情况
附条件或附期限的合同：
- 当事人可约定合同效力附条件或附期限。附生效条件的合同，在条件成就时生效；附生效期限的合同，在期限届满时生效。例如，若合同中约定“甲方通过某项考试后合同生效”，则即使双方已签字盖章，合同也需在甲方通过考试后方能生效。
需办理批准等手续的合同：
- 对于某些特定类型的合同，如中外合资经营企业合同、中外合作经营企业合同等，需经审批机关批准后才能生效。未办理相关批准手续，将影响合同的生效。但此不影响合同中履行报批等义务条款的效力。
合同主体不具备相应民事行为能力：
- 无民事行为能力人签订的合同无效。限制民事行为能力人签订的纯获利益的合同或与其年龄、智力、精神健康状况相适应的合同有效，其他合同则需经法定代理人同意或追认后才有效。例如，不满八周岁的未成年人签订的合同通常无效。
意思表示不真实：
- 若合同是基于虚假的意思表示、胁迫或其他非法手段订立的，则合同无效或可被撤销。例如，一方以威胁对方生命安全的方式迫使对方签订合同，受胁迫方有权请求法院或仲裁机构撤销该合同。
违反法律、行政法规的强制性规定或违背公序良俗：
- 合同内容若违反法律、行政法规的强制性规定，或违背社会公德和善良风俗，则合同无效。例如，买卖毒品的合同因违反法律强制性规定而无效。
三、实际操作中的注意事项
- 仔细审查合同条款：在签订合同时，双方应仔细审查合同条款，确保合同内容的合法性、真实性以及双方主体资格的适格性。特别是对于合同生效的条件，应明确约定并理解其含义。
- 办理相关手续：对于需办理批准等手续的合同，应严格按照法律规定办理相关手续，以确保合同的合法有效。
- 保留证据：在合同签订和履行过程中，双方应保留好相关证据，如签字盖章的原件、沟通记录、实际履行行为的证据等，以备在合同效力发生争议时作为证明。
四、法律建议
- 如果对合同效力存在争议，或者合同条款存在模糊不清、理解歧义的情况，建议及时向我咨询，我会根据具体情况提供针对性的法律分析和解决方案。
- 在签订合同时，也可以考虑咨询专业律师，以确保合同条款的合法性和有效性，避免不必要的法律风险。
综上所述，合同中约定对方盖章签字后生效，这一条款本身并无问题，但合同的最终生效与否还需根据具体情况及法律规定来判断。在签订合同时，双方应仔细审查合同条款，确保合同的合法性和有效性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。