在高速公路上因车辆故障以40码低速行驶，交警可能根据具体情况作出以下处罚：

1. 若车辆故障属不可抗力且已采取安全措施：

   • 根据《道路交通安全法实施条例》第七十八条，高速公路最低车速不得低于60公里/小时（特殊路段除外）。但若车辆因突发故障无法维持正常速度，且驾驶员已开启双闪灯、在车后150米外设置警示标志，并尽快移至应急车道或联系救援，交警通常不会直接处罚，但可能口头警告要求立即整改。
   • 法律依据：安全措施到位是免责关键，若未设置警示标志或未移至应急车道，可能因“低速行驶”和“未按规定设置警示标志”被合并处罚。

2. 若车辆故障可排除但未及时处理：

   • 若车辆故障可临时修复（如轮胎漏气、发动机小故障），但驾驶员未尝试修复或未联系救援，而是持续以40码低速行驶，交警可能以“驾驶机动车在高速公路上正常情况下行驶速度低于规定最低时速20%以上”为由，处警告或20元以上200元以下罚款，并扣3分。
   • 法律依据：《道路交通安全违法行为记分管理办法》第十一条规定，此类行为记3分；《道路交通安全法》第九十条明确罚款幅度。

3. 若车辆故障导致交通拥堵或事故：

   • 若低速行驶引发后方车辆排队或追尾事故，驾驶员可能因“低速行驶”和“未确保安全”承担主要或全部责任，除罚款扣分外，还需赔偿事故损失。
   • 法律依据：《道路交通安全法》第二十二条要求驾驶员确保安全驾驶，若因故障未及时处理导致事故，需承担相应责任。

建议：

• 车辆故障时，立即开启双闪灯，将车移至应急车道，在车后150米外设置警示标志，并拨打12122高速救援电话。
• 若无法移动车辆，人员迅速撤离至护栏外，避免二次事故。
• 保留故障证据（如照片、视频），以便后续处理争议。

若您遇到类似情况或需进一步法律帮助，可直接向我咨询，我会结合具体细节为您提供专业建议。