在工程设计存在质量问题的情况下，能否支付剩余费用，这并非一个简单的是非问题，而是需要根据具体情况来综合判断的。以下是我从不同角度为你进行的分析：

一、合同条款的约定

1. 合同中有明确约定：

   • 如果合同中明确规定了工程设计质量问题的处理方式，包括是否支付剩余费用、支付的条件和比例等，那么双方应当按照合同约定执行。例如，合同可能规定，若设计存在质量问题，发包方有权扣除部分或全部剩余费用作为违约金或赔偿。

2. 合同中未明确约定：

   • 若合同中没有明确约定工程设计质量问题的处理方式，那么双方需要依据《中华人民共和国民法典》等相关法律法规，通过协商、调解、仲裁或诉讼等方式来解决争议。

二、质量问题的性质和严重程度

1. 轻微质量问题：

   • 如果设计质量问题较为轻微，不影响工程的整体使用和安全，且承包方能够及时采取补救措施进行修复，那么发包方可能仍然需要支付剩余费用，但可能会扣除部分费用作为对质量问题的惩罚或补偿。

2. 严重质量问题：

   • 如果设计质量问题严重，导致工程无法正常使用或存在安全隐患，且承包方无法及时或有效修复，那么发包方有权拒绝支付剩余费用，并可能要求承包方承担违约责任或赔偿损失。

三、双方的责任和义务

1. 承包方的责任：

   • 承包方作为工程设计的提供者，有义务确保设计质量符合合同约定和法律法规要求。如果设计存在质量问题，承包方应当承担修复责任，并可能因此承担违约责任或赔偿损失。

2. 发包方的责任：

   • 发包方作为工程设计的接受者，有义务按照合同约定支付费用。但是，如果设计存在质量问题，且该问题影响了工程的整体使用和安全，发包方有权要求承包方进行修复，并在修复完成前暂停支付剩余费用。

四、法律后果和救济途径

1. 法律后果：

   • 如果双方无法就剩余费用的支付问题达成一致，可能会引发法律纠纷。在纠纷解决过程中，法院或仲裁机构会根据合同约定、法律法规以及双方提供的证据来综合判断剩余费用的支付问题。

2. 救济途径：

   • 双方可以通过协商、调解、仲裁或诉讼等方式来解决争议。在协商和调解不成的情况下，可以向仲裁机构申请仲裁或向人民法院提起诉讼。

建议：在面对工程设计质量问题时，双方应当首先回顾合同条款，明确各自的权利和义务。如果合同中有明确约定，则按照约定执行；如果合同中没有明确约定，则双方应当积极沟通协商，寻求合理的解决方案。如果协商不成，可以考虑通过法律途径来解决争议。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。