合同上只有甲乙方签字，在大多数情况下是有效的，但具体还需看合同内容、双方行为以及是否存在特殊情形。以下是对这一问题的详细分析：
一、一般情况下的合同效力
根据《中华人民共和国民法典》第四百九十条的规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。这意味着，在一般情况下，合同需要双方或多方当事人的签字、盖章或按指印来确认合同的成立和生效。如果合同上只有甲乙方签字，且双方均具备相应的民事行为能力，合同内容不违反法律或行政法规的禁止性规定，且是双方真实意思的表示，那么该合同通常是有效的。
二、特殊情况下的合同效力
尽管在大多数情况下，只有甲乙方签字的合同是有效的，但也存在一些特殊情形，可能影响合同的效力：
实际履行接受：
- 如果一方在合同上签字后，按照合同约定履行了主要义务，而另一方通过接受履行的行为表示了对合同内容的认可，那么即使合同在形式上可能存在某些瑕疵（如一方未盖章或按指印），合同也可能被视为成立并生效。例如，甲在买卖合同上签字并发货，乙接收货物且无异议，此时合同即成立并生效。
其他明确同意方式：
- 如果有确凿证据证明未签字方以其他方式（如邮件、短信等书面记录，或口头承诺并有证据支持）明确表示了同意合同内容的意思，这也可能使合同具备有效性。这种情况下，虽然未直接签字，但当事人的意思表示已经得到了充分的体现和确认。
表见代理或职务行为：
- 如果一方有理由相信另一方的某个行为或某人的行为代表了另一方的意思表示，从而签订了合同，即使在另一方实际上并未签字的情况下，只要符合表见代理或职务行为的法律规定，合同也可能被认定为有效。例如，甲公司的员工长期负责与乙公司的业务往来，并持有相关授权文件。在一次交易中，该员工以甲公司名义与乙公司签订合同，虽只有乙公司签字（或甲公司员工签字但未加盖公司公章），但由于员工的行为构成表见代理或职务行为，合同可能被认定有效。
三、法律建议
确保合同形式完备：
- 为了避免潜在的纠纷和风险，建议在签订合同时尽量确保双方都进行签字或盖章确认。如果条件允许，还可以考虑使用电子签名等更加便捷且具备法律效力的方式。
保留相关证据：
- 在合同履行过程中，务必保留好与合同相关的所有证据，如发货单、收货单、付款凭证等。这些证据在发生纠纷时将起到至关重要的作用。
及时咨询专业律师：
- 如果对合同的效力或履行过程中遇到的问题存在疑问，建议及时咨询专业律师以获取准确的法律意见。律师将根据具体情况进行详细分析，并提供有针对性的法律建议。
综上所述，合同上只有甲乙方签字在大多数情况下是有效的，但具体还需看合同内容、双方行为以及是否存在特殊情形。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。