若要证明公司单方持有的手写工资证明原件后来被添加了条款，核心在于通过证据收集与分析来还原事实真相，关键在于证明添加行为的存在及时间点。以下从不同角度为你详细分析：
证据收集角度
- 寻找原始记录或副本
- 寻找其他副本：尝试回忆是否在工资证明出具时，自己留存过副本，比如通过拍照、复印等方式。如果当时有拍照，照片上的内容就可以作为原始工资证明条款的直接证据，与现在公司持有的原件进行对比，若原件条款增多，就能初步证明存在添加行为。
- 查找相关邮件或聊天记录：如果工资证明是通过邮件发送或者在公司内部沟通软件中提及过相关内容，查找这些电子记录。邮件或聊天记录中关于工资证明条款的描述，可能和原始内容一致，以此作为对比依据。例如，在邮件中公司明确说明了工资证明包含的条款，而和现在公司持有的原件条款不符，就可以证明原件被添加了条款。
- 证人证言
- 同事证言：如果有同事当时在场见证了工资证明的出具过程，或者知晓工资证明原本的条款内容，可以请他们作为证人提供证言。同事的证言可以从侧面证明工资证明原始条款的情况，以及是否存在后来添加条款的可能性。不过，同事可能因为与公司存在利益关系，其证言的证明力可能会受到一定影响，但结合其他证据仍有一定的参考价值。
- 其他相关人员证言：比如当时负责办理工资证明相关手续的财务人员、人力资源部门的其他工作人员等，他们可能对工资证明的原始情况有所了解，他们的证言也可以作为证据之一。
- 专业鉴定
- 笔迹形成时间鉴定：可以申请对工资证明上不同条款的笔迹形成时间进行鉴定。通过专业的鉴定机构，利用科学的技术手段，判断各条款是否是在同一时间形成。如果鉴定结果显示部分条款的形成时间明显晚于其他条款，就可以证明这些条款是后来添加的。不过，笔迹形成时间鉴定存在一定的技术难度和局限性，鉴定结果也可能存在一定的误差。
- 纸张和墨水鉴定：对工资证明所使用的纸张和墨水进行分析鉴定。如果发现纸张有被更换或者墨水的成分、使用时间等存在异常，也可能暗示工资证明被篡改过，存在后来添加条款的情况。
法律程序角度
- 与公司协商沟通
- 书面沟通：可以先以书面形式（如邮件、信函）与公司进行沟通，明确指出你认为工资证明原件被添加了条款的情况，并要求公司提供原始的、未经修改的工资证明或者对添加条款的行为进行解释说明。在书面沟通中，要注意保留好相关的证据，如邮件的发送记录、信函的寄送凭证等。
- 协商会议：如果书面沟通效果不佳，可以尝试与公司协商召开会议，在会议上提出自己的疑问和证据，要求公司给出合理的答复。在会议过程中，可以做好记录，最好有会议纪要，并要求参会人员签字确认，以便后续作为证据使用。
- 申请劳动仲裁或提起诉讼
- 劳动仲裁：如果与公司协商无果，且该工资证明涉及到劳动报酬、工作时间等劳动权益相关的问题，可以向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。在仲裁过程中，你需要提交自己收集到的各类证据，证明工资证明原件被添加了条款，以及这种添加行为对自己权益造成的损害。仲裁委员会会根据双方提供的证据和相关法律法规进行裁决。
- 提起诉讼：如果对劳动仲裁结果不满意，或者该工资证明问题不属于劳动仲裁的受理范围，你可以向人民法院提起诉讼。在诉讼过程中，要按照法院的要求提交证据，进行举证、质证等诉讼活动。法院会依据事实和法律作出公正的判决。
在处理这类问题时，证据的收集和保存至关重要，每一个环节都要尽可能做到严谨、细致。如果你还有其他疑问或者需要进一步的帮助，随时都可以向我咨询。