针对您提出的“集体土地上违法建筑怎么没收”的问题，这是一个涉及法律程序和行政执法的复杂过程。以下是我为您详细梳理的解答：
一、法律依据与适用条件
首先，我们需要明确没收的法律依据。根据《中华人民共和国城乡规划法》第六十四条及第六十八条的规定，对于未取得建设工程规划许可证或未按许可证规定建设的建筑物，若无法采取改正措施消除影响，县级以上地方人民政府有权责成相关部门采取查封施工现场、强制拆除等措施，其中在特定条件下，也包括没收违法建筑物的选项。这里的“无法采取改正措施”是启动没收程序的关键前提。
适用没收的条件通常包括：
- 实质性违法：违法行为已达到无法通过补办手续、罚款等方式纠正的程度。
- 公共利益考量：保留建筑物可能严重损害城乡规划秩序或公共安全。
- 程序合法性：需经过调查取证、听证等法定程序确认违法事实。
二、实施没收的具体流程
调查认定阶段：
- 由城乡规划主管部门联合自然资源部门开展现场勘查，收集土地性质、建设时间等证据。
- 通过卫星影像比对、产权登记查询等手段核实建筑物的合法性。
- 制作《违法建筑认定书》，明确违法事实及拟处理意见。
听证告知程序：
- 向当事人送达《行政处罚事先告知书》，告知其陈述申辩的权利。
- 对重大案件组织听证会，允许当事人提交证据并质证。
- 根据听证结果调整处罚决定，确保程序的正当性。
没收执行环节：
- 政府作出没收决定后，由不动产登记机构办理产权变更登记，将建筑物纳入国有资产管理。
- 被没收的建筑物可用于公益用途，如社区服务中心、公共设施等。
- 在特殊情况下，也可以依法拍卖变现，所得款项上缴国库。
三、特殊情况与注意事项
- 违法建筑的征收与处理：在集体土地上进行的违法建设，其房屋被视为违法建筑。在特定情况下，如为了公共利益需要进行征收时，这些违法建筑通常不会给予经济补偿，以体现对违法行为的惩戒原则。
- 程序瑕疵风险：在没收过程中，必须严格遵守法定程序，如未履行听证程序可能导致行政诉讼败诉。因此，建议制作全程执法记录，保存勘验笔录、询问笔录等关键证据。
- 执行阻力应对：对于拒不配合的当事人，可以申请法院强制执行。同时，建立多部门联动机制，提前制定应急预案，以应对可能出现的执行阻力。
- 社会稳定考量：在处理涉及民生类的违建时，如老旧小区顶楼加建等，需要谨慎评估其对社会稳定的影响。可以探索“拆改结合”的模式，优先保障居民的基本居住需求。
四、总结与建议
没收集体土地上的违法建筑是一个严肃且复杂的法律程序，它要求我们在保护土地资源、维护城乡规划秩序的同时，也要兼顾公共利益和社会稳定。因此，在实施没收前，必须确保程序的合法性和正当性，充分听取当事人的意见和申辩。同时，政府及相关部门也应加强监管和执法力度，及时发现并处理违法行为，以维护公共利益和社会秩序。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的咨询，请随时告诉我。