事业单位注销后，经济补偿金的计算需根据具体情况确定，主要取决于事业单位的性质、注销原因及员工劳动合同的履行情况。以下分情况详细说明：

1. 事业单位转制为企业后注销
   若事业单位因转制为企业（如改为公司制）后注销，员工与原事业单位的劳动合同通常由改制后的企业承继。此时若企业因注销终止劳动合同，经济补偿金的计算需依据《劳动合同法》第四十七条：

   • 计算标准：按员工在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资。
     
   • 工资基数：以员工终止劳动合同前十二个月的平均工资为准，若平均工资高于当地上年度职工月平均工资三倍的，按三倍标准支付，且补偿年限最高不超过十二年。
     
   • 特殊情形：若改制时已与员工协商一致解除合同并支付补偿，注销时可能不再重复计算，需以双方协议为准。

2. 事业单位因政策性关闭或撤销后注销
   若事业单位因政策性原因（如机构改革、职能调整）直接关闭或撤销，员工经济补偿金的计算可能适用《劳动合同法》或地方性政策：

   • 无改制承继情形：若注销时未由其他单位承继劳动合同，单位需按《劳动合同法》第四十七条支付经济补偿，标准与上述转制情形一致。
     
   • 地方性政策差异：部分地区可能针对事业单位注销制定特殊补偿方案（如提高补偿标准或增加生活补助），需以当地政策文件为准。例如，某些省份规定事业单位注销时，员工工作年限超过十二年的部分，可按更高比例计算补偿。

3. 员工与单位协商一致解除合同
   若事业单位注销前，员工与单位通过协商一致解除劳动合同，经济补偿金可由双方约定，但不得低于法定标准（《劳动合同法》第四十七条）。若约定高于法定标准，以约定为准。

4. 单位违法解除或终止合同
   若事业单位注销时存在违法解除劳动合同的情形（如未依法支付补偿、未履行法定程序），员工有权要求单位按经济补偿标准的二倍支付赔偿金（《劳动合同法》第八十七条）。

温馨提示：

• 事业单位注销涉及劳动关系终止时，单位需依法履行通知、协商、补偿等义务，否则可能面临劳动仲裁或诉讼风险。
  
• 若您所在单位正在注销或已注销，且对经济补偿金计算有疑问，可直接向我提供具体信息（如单位性质、注销原因、劳动合同履行情况等），我将为您进一步分析。