在买卖合同中，当双方已经约定了违约金后，是否还能主张逾期付款损失（通常表现为逾期利息或资金占用损失）是一个涉及合同条款、违约情况以及法律法规的复杂问题。以下是对这一问题的详细解答：
一、违约金与逾期付款损失的法律性质
违约金：是合同双方预先约定的，当一方违约时，应向对方支付的一定数额的金钱。它具有补偿性和惩罚性双重属性，旨在弥补守约方因违约所遭受的损失，并在一定程度上惩罚违约方。
逾期付款损失（逾期利息/资金占用损失）：是因违约方未按时付款而给守约方造成的实际损失，通常表现为资金被占用的利息损失或因资金短缺而产生的其他额外损失。它属于法定孳息范畴，是守约方因违约行为而直接遭受的损失。
二、一般情况下的处理原则
在大多数情况下，违约金和逾期付款损失在功能上具有重叠性，都是为了补偿守约方因违约所遭受的损失。因此，从民法的公平原则和补偿性为主、惩罚性为辅的违约赔偿理念出发，如果同时支持违约金和逾期付款损失，可能会导致守约方获得超过其实际损失的赔偿。所以，在一般情况下，守约方不能既主张违约金又主张逾期付款损失。
三、特殊情况下的处理原则
然而，在特殊情形下，守约方可以同时主张违约金和逾期付款损失，但需确保总和不过分高于实际损失。这些特殊情形包括：
合同明确约定：如果合同中明确约定了可以同时主张违约金和逾期付款损失，并且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么守约方可以按照合同约定同时主张。
违约金不足以弥补损失：根据《民法典》等相关规定，如果违约金低于违约行为所造成的实际损失，守约方可以请求增加违约金以弥补损失。在这种情况下，如果逾期付款损失（如资金占用利息）是实际损失的一部分，且违约金未覆盖该部分损失，守约方可以主张逾期付款损失的差额。
额外损失的情形：如果违约方的逾期付款行为不仅给守约方造成了资金占用的利息损失，还导致了其他额外损失（如错过商业机会、产生额外费用等），且合同中明确约定可以同时主张违约金和逾期付款损失，那么守约方在提供充分证据证明其实际损失的情况下，可以依法同时主张。
四、法律建议与操作提示
合同条款设计：在签订合同时，双方应谨慎考虑违约责任的约定。如果希望同时主张违约金和逾期付款损失，应在合同中明确约定，并明确二者的计算方式和关系。
证据准备：在主张逾期付款损失时，守约方需要提供充分的证据来证明其实际损失以及违约金和逾期付款损失的合理性。这可能包括资金被占用的证明、额外损失的证明等。
咨询专业律师：由于这类问题涉及复杂的法律条款和司法实践，建议在处理时咨询专业律师。律师可以根据具体的合同条款、违约情况以及法律法规的规定，为当事人提供专业的法律意见和诉讼策略。
综上所述，买卖合同中约定了违约金后，是否可以主张逾期付款损失取决于具体的合同条款、违约情况以及法律法规的规定。在一般情况下不能同时主张，但在特殊情形下可以同时主张，且需确保总和不过分高于实际损失。