机关事业单位合同能源零投入项目是否需要招投标，需分情况讨论，具体如下：

1. 若项目金额达到政府采购限额标准
   根据《中华人民共和国政府采购法》及其实施条例，机关事业单位使用财政性资金采购货物、工程和服务，若合同能源管理项目（含零投入模式）的预算金额达到政府采购限额标准（具体标准由省级政府规定，通常为货物和服务类50万元以上、工程类60万元以上），则必须通过公开招标、邀请招标等法定采购方式实施。即使采用合同能源管理零投入模式（即由能源服务公司全额投资改造，机关事业单位以节能收益分期支付费用），仍属于政府采购范畴，需履行招投标程序。

2. 若项目金额未达到政府采购限额标准
   若项目预算未达限额标准，机关事业单位可自主选择采购方式，无需强制招投标。但需注意：

   • 内部审批程序：仍需按单位内部财务管理制度履行审批流程，确保资金使用合规；
     
   • 竞争性谈判或询价：为保证公平性，建议采用竞争性谈判、询价或单一来源采购（需符合法定情形）等方式选择能源服务公司；
     
   • 合同规范性：需签订书面合同，明确节能目标、收益分配、违约责任等条款，避免后续纠纷。

3. 特殊情形：涉及公共利益或国家安全
   若项目涉及公共安全、国家秘密等特殊领域，即使金额未达限额标准，也可能需适用《招标投标法》中“必须招标项目”的例外规定（如使用国际组织或外国政府贷款的项目），此时需根据具体情形判断是否需招投标。

建议：机关事业单位在实施合同能源管理项目前，应首先核算项目预算金额，并咨询同级财政部门或政府采购监管机构确认是否需招投标；若需招投标，应严格编制招标文件、组织评标，避免程序瑕疵导致合同无效或行政处罚。如有进一步疑问，可直接向我咨询。