监管资金冻结期间，原则上不能擅自支付工程款，但存在例外情形。以下从不同角度进行分析：

1. 监管资金冻结的常规限制
   监管资金（如预售资金、专项账户资金）通常因诉讼保全、行政处罚等原因被冻结，其核心目的是保障资金安全、防止转移。根据《民事诉讼法》《行政强制法》等规定，冻结期间账户内资金原则上“只进不出”，未经法院或行政机关许可，任何单位或个人不得擅自支取。若擅自支付工程款，可能构成“擅自处分被查封财产”，需承担民事赔偿责任（《民法典》第1165条），甚至面临行政处罚（《行政处罚法》第28条）。

2. 例外情形：法院或行政机关许可支付
   若工程款支付符合以下条件，可申请解冻或部分支付：

   • 法院许可：在诉讼保全中，若承包方（施工方）能证明工程款支付与案件无关，或支付后仍能保障债权人利益（如剩余资金足够覆盖保全标的），可向法院申请解冻或部分支付（《民事诉讼法》第107条）。
     
   • 行政机关同意：若资金因行政处罚被冻结（如税务、住建部门），承包方可与行政机关协商，提供担保或证明支付必要性（如避免工程烂尾、保障农民工工资），申请临时解冻。
     
   • 合同约定优先：若监管协议或施工合同明确约定“冻结期间可支付工程款”（如按进度拨款条款），且该约定不违反法律强制性规定，可能被认定为有效，但需以法院或行政机关认可为前提。

3. 实务建议

   • 立即停止擅自支付：若资金已被冻结，切勿自行划转，否则可能扩大法律风险。
     
   • 收集证据：整理工程款支付依据（如合同、进度证明、农民工工资表等），证明支付的合理性与必要性。
     
   • 申请解冻或部分支付：向冻结机关（法院或行政机关）提交书面申请，附上证据材料，争取解冻或部分支付。
     
   • 协商调解：与冻结申请人（如债权人、行政机关）沟通，尝试通过调解达成支付方案（如分期支付、提供担保）。

总结：监管资金冻结期间支付工程款需严格依法操作，擅自支付风险极高。建议优先通过法律程序申请解冻或部分支付，并保留完整证据链。如有具体案件，可进一步向我咨询细节。