在注册登记过程中，如果发现存在违法行为，特别是假冒企业登记或冒用他人身份信息取得公司登记的情况，应当按照以下步骤和规定进行处理：
一、假冒企业登记违法行为的处理
发现与报告：
- 企业或个人在发现被假冒登记后，应立即向该假冒登记所在的登记机关提出调查申请，并提供相关证据材料，如身份证明、企业登记文件等，以证明其被假冒的事实。
登记机关的受理与调查：
- 登记机关在收到调查申请后，应在3个工作日内作出是否受理的决定，并书面通知申请人。
- 受理申请后，登记机关应在3个月内完成调查，并及时作出撤销或者不予撤销登记的决定。若情形复杂，经登记机关负责人批准，可以延长3个月。
- 在调查期间，若相关企业和人员无法联系或拒不配合，登记机关可通过国家企业信用信息公示系统向社会公示相关信息，公示期为45日。若无异议，登记机关可依法撤销其企业登记。
撤销登记与公示：
- 若假冒企业登记违法行为事实清楚，或符合其他依法应当撤销登记的情形，登记机关应撤销登记。
- 撤销登记后，登记机关应在20个工作日内通过国家企业信用信息公示系统向社会公示，包括被撤销登记的日期、原因及作出撤销决定的机关等信息。
法律责任：
- 提交虚假材料或采取其他欺诈手段隐瞒重要事实取得企业登记的，由登记机关依法责令改正，没收违法所得，并处以罚款；情节严重的，吊销营业执照，并对直接责任人依法作出处理。
- 明知或应当知道申请人提交虚假材料仍接受委托代为办理或协助虚假登记的，由登记机关没收违法所得，并处以罚款。
二、冒用他人身份信息取得公司登记的处理
被冒用人的诉求：
- 被冒用身份信息取得公司登记的人民群众（被冒用人）应向市场监管部门反映情况，提出撤销冒名登记的诉求。
市场监管部门的应对：
- 各级市场监管部门应积极应对被冒用人的诉求，扎实开展撤销冒名登记工作。
- 市场监管部门在调查过程中，若发现涉嫌构成伪造印章、诈骗等犯罪行为的，应及时移送公安机关处理。
撤销冒名登记：
- 经调查核实，确认存在冒名登记行为的，市场监管部门应依法撤销该登记，并恢复被冒用人的合法权益。
三、综合建议
- 加强实名制与身份核验：在注册登记过程中，应严格执行实名制，加强身份核验，确保申请人身份的真实性和合法性。
- 完善信息共享机制：市场监督管理部门应与相关部门建立信息共享机制，强化信息共享核验，加强源头预防，推进全过程控制。
- 加强宣传教育：通过多种渠道加强对企业登记法律法规的宣传教育，提高公众的法律意识和风险防范意识。
总之，对于注册登记过程中发现的违法行为，应依法进行调查处理，并加强源头预防和全过程控制，以维护市场秩序和交易安全。