结论：非法经营员工获利2万是否能不起诉，不能一概而论，需结合具体案情、证据情况以及法律规定综合判断。以下从不同角度进行分析：
一、从非法经营罪的构成要件角度分析
非法经营罪，是指违反国家规定，有下列非法经营行为之一，扰乱市场秩序，情节严重的行为：
- 未经许可经营法律、行政法规规定的专营、专卖物品或者其他限制买卖的物品的；
- 买卖进出口许可证、进出口原产地证明以及其他法律、行政法规规定的经营许可证或者批准文件的；
- 未经国家有关主管部门批准非法经营证券、期货、保险业务的，或者非法从事资金支付结算业务的；
- 其他严重扰乱市场秩序的非法经营行为。
若员工的行为符合上述非法经营罪的构成要件，且情节严重，那么就可能构成非法经营罪。而“情节严重”的认定，通常涉及经营数额、违法所得数额、经营数量、经营次数等多个方面。获利2万只是违法所得数额的一个方面，是否达到“情节严重”的标准，还需结合其他因素综合判断。
二、从员工在非法经营中的地位和作用角度分析
如果员工只是普通执行者：
- 若员工在非法经营活动中只是按照上级指示行事，没有决策权，且对非法经营活动的整体情况了解有限，那么其责任相对较轻。
- 在这种情况下，如果员工获利2万，但整体非法经营活动的情节并不严重，或者员工有自首、立功等法定从轻、减轻情节，那么有可能不被起诉或者获得较轻的处罚。
如果员工是主要负责人或积极参与者：
- 若员工在非法经营活动中起主要作用，或者积极参与非法经营活动的策划、组织、实施等环节，那么其责任相对较重。
- 在这种情况下，即使员工获利2万，但如果整体非法经营活动的情节严重，那么员工很可能构成非法经营罪，并被依法追究刑事责任。
三、从证据情况和法律程序角度分析
证据情况：
- 起诉与否还取决于证据的充分性和确凿性。如果证据不足或者存在瑕疵，那么可能影响起诉的决定。
- 例如，如果无法证明员工的获利与非法经营活动有直接关联，或者无法证明员工明知是非法经营活动而参与，那么可能影响对员工的定罪和起诉。
法律程序：
- 在刑事诉讼过程中，检察院会根据案件情况决定是否起诉。如果检察院认为案件证据不足、情节轻微或者存在其他法定不起诉情形，那么可能作出不起诉决定。
- 同时，员工也有权委托律师进行辩护，提出无罪、罪轻或者减轻、免除处罚的材料和意见，以维护自己的合法权益。
建议：如果您或您身边的人涉及非法经营案件，且获利2万，建议尽快咨询专业律师（即我，储博刚律师，专注于刑事辩护等领域）。我将根据具体案情、证据情况以及法律规定，为您提供全面的法律分析和建议，帮助您更好地应对法律挑战。