结论：父亲将自建房产抵押给女儿，抵押合同是否有效需视具体情况而定，主要取决于房屋产权状况、抵押合同内容合法性以及是否依法办理相关手续。

详细分析：

1. 房屋产权状况

   • 合法产权且为父亲个人所有：若自建房具有合法产权，且产权明确归属于父亲个人，那么抵押合同的效力将主要取决于父亲与女儿之间的约定是否符合法律规定。在此情况下，只要双方意思表示真实，抵押合同内容不违反法律法规的强制性规定，抵押合同即有效。
   • 无合法产权或涉及家庭共同财产：若自建房没有合法产权，或者房屋产权涉及家庭共同财产（如夫妻共同财产、家庭共有财产等），则抵押行为可能存在效力瑕疵。特别是若房屋为家庭共有，父亲擅自抵押且未经其他共有人同意，将导致抵押行为无效或无法顺利实现抵押权。

2. 抵押合同内容合法性

   • 抵押合同的内容必须合法，不得违反法律法规的强制性规定。例如，抵押合同中不得约定违反法律、行政法规的强制性规定或者损害社会公共利益的条款。若抵押合同内容存在违法情形，则抵押合同无效。

3. 依法办理相关手续

   • 为了保证抵押的有效性和顺利实现抵押权，一般应当办理抵押物登记手续（如果法律规定该类抵押物需要登记才生效的话）。未办理登记可能会影响债权人在实现抵押权时的优先受偿权等权益。因此，即使父亲与女儿之间签订了抵押合同，若未依法办理抵押登记，也可能影响抵押合同的效力。

法律建议：

• 确认房屋产权状况：在签订抵押合同前，应首先确认自建房的产权状况，确保房屋具有合法产权且产权明确归属于父亲个人。若房屋产权涉及家庭共同财产，应取得其他共有人的同意。
• 审查抵押合同内容：抵押合同的内容应合法、明确、具体，不得违反法律法规的强制性规定。建议咨询专业律师对抵押合同进行审查，以确保合同的合法性和有效性。
• 依法办理抵押登记：若法律规定该类抵押物需要登记才生效，应依法办理抵押物登记手续。抵押登记是保障抵押权有效实现的重要环节，不可忽视。

可能法律后果：

• 若抵押合同有效且依法办理了抵押登记，女儿在父亲不履行债务时，有权依法实现抵押权，以抵押物折价或者以拍卖、变卖该抵押物的价款优先受偿。
• 若抵押合同无效或未依法办理抵押登记，女儿可能无法顺利实现抵押权，其债权可能受到损害。

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